Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ms4a1P19437 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ms4a1P19437 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ms4a1P19437 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ms4a1P19437 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ms4a1P19437 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ms4a1P19437 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ms4a1P19437 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ms4a1P19437 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ms4a1P19437 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ms4a1P19437 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ms4a1P19437 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ms4a1P19437 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ms4a1P19437 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ms4a1P19437 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ms4a1P19437 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ms4a1P19437 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ms4a1P19437 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ms4a1P19437 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ms4a1P19437 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ms4a1P19437 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ms4a1P19437 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ms4a1P19437 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ms4a1P19437 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ms4a1P19437 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ms4a1P19437 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ms4a1P19437 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ms4a1P19437 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ms4a1P19437 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ms4a1P19437 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ms4a1P19437 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ms4a1P19437 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ms4a1P19437 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ms4a1P19437 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ms4a1P19437 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ms4a1P19437 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ms4a1P19437 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ms4a1P19437 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ms4a1P19437 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ms4a1P19437 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ms4a1P19437 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ms4a1P19437 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ms4a1P19437 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ms4a1P19437 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ms4a1P19437 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ms4a1P19437 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ms4a1P19437 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ms4a1P19437 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ms4a1P19437 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ms4a1P19437 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ms4a1P19437 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ms4a1P19437 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ms4a1P19437 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ms4a1P19437 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ms4a1P19437 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ms4a1P19437 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ms4a1P19437 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ms4a1P19437 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ms4a1P19437 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ms4a1P19437 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ms4a1P19437 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ms4a1P19437 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ms4a1P19437 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ms4a1P19437 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ms4a1P19437 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ms4a1P19437 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ms4a1P19437 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ms4a1P19437 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ms4a1P19437 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ms4a1P19437 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ms4a1P19437 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ms4a1P19437 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ms4a1P19437 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ms4a1P19437 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ms4a1P19437 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ms4a1P19437 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ms4a1P19437 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ms4a1P19437 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ms4a1P19437 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ms4a1P19437 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ms4a1P19437 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ms4a1P19437 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ms4a1P19437 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ms4a1P19437 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ms4a1P19437 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ms4a1P19437 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ms4a1P19437 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ms4a1P19437 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ms4a1P19437 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ms4a1P19437 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ms4a1P19437 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ms4a1P19437 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ms4a1P19437 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ms4a1P19437 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ms4a1P19437 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ms4a1P19437 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ms4a1P19437 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ms4a1P19437 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ms4a1P19437 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ms4a1P19437 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms