Protein–RNA interactions for Protein: P18337

Sell, L-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SellP18337 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SellP18337 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SellP18337 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SellP18337 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SellP18337 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SellP18337 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SellP18337 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SellP18337 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SellP18337 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SellP18337 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SellP18337 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SellP18337 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SellP18337 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SellP18337 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SellP18337 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SellP18337 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SellP18337 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SellP18337 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SellP18337 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SellP18337 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SellP18337 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SellP18337 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SellP18337 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SellP18337 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SellP18337 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SellP18337 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SellP18337 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SellP18337 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SellP18337 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SellP18337 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SellP18337 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SellP18337 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SellP18337 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SellP18337 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SellP18337 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SellP18337 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SellP18337 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SellP18337 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SellP18337 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SellP18337 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SellP18337 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SellP18337 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SellP18337 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SellP18337 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SellP18337 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SellP18337 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SellP18337 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SellP18337 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SellP18337 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SellP18337 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SellP18337 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SellP18337 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SellP18337 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SellP18337 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SellP18337 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SellP18337 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SellP18337 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SellP18337 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SellP18337 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SellP18337 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SellP18337 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SellP18337 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SellP18337 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SellP18337 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SellP18337 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SellP18337 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SellP18337 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SellP18337 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SellP18337 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SellP18337 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SellP18337 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SellP18337 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SellP18337 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SellP18337 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SellP18337 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SellP18337 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SellP18337 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SellP18337 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SellP18337 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SellP18337 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SellP18337 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SellP18337 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SellP18337 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SellP18337 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SellP18337 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SellP18337 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SellP18337 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SellP18337 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SellP18337 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SellP18337 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SellP18337 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SellP18337 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SellP18337 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SellP18337 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SellP18337 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SellP18337 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SellP18337 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SellP18337 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SellP18337 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SellP18337 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms