Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Defa-rs1P17533 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Defa-rs1P17533 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Defa-rs1P17533 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Defa-rs1P17533 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Defa-rs1P17533 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Defa-rs1P17533 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Defa-rs1P17533 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Defa-rs1P17533 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Defa-rs1P17533 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Defa-rs1P17533 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Defa-rs1P17533 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Defa-rs1P17533 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Defa-rs1P17533 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Defa-rs1P17533 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Defa-rs1P17533 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Defa-rs1P17533 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Defa-rs1P17533 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Defa-rs1P17533 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Defa-rs1P17533 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Defa-rs1P17533 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Defa-rs1P17533 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Defa-rs1P17533 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Defa-rs1P17533 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Defa-rs1P17533 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Defa-rs1P17533 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Defa-rs1P17533 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Defa-rs1P17533 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Defa-rs1P17533 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Defa-rs1P17533 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Defa-rs1P17533 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Defa-rs1P17533 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Defa-rs1P17533 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Defa-rs1P17533 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Defa-rs1P17533 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Defa-rs1P17533 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Defa-rs1P17533 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Defa-rs1P17533 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Defa-rs1P17533 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Defa-rs1P17533 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Defa-rs1P17533 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Defa-rs1P17533 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Defa-rs1P17533 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Defa-rs1P17533 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Defa-rs1P17533 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Defa-rs1P17533 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Defa-rs1P17533 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Defa-rs1P17533 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Defa-rs1P17533 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Defa-rs1P17533 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Defa-rs1P17533 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Defa-rs1P17533 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Defa-rs1P17533 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Defa-rs1P17533 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Defa-rs1P17533 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Defa-rs1P17533 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Defa-rs1P17533 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Defa-rs1P17533 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Defa-rs1P17533 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Defa-rs1P17533 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Defa-rs1P17533 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Defa-rs1P17533 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Defa-rs1P17533 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Defa-rs1P17533 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Defa-rs1P17533 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Defa-rs1P17533 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Defa-rs1P17533 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Defa-rs1P17533 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Defa-rs1P17533 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Defa-rs1P17533 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Defa-rs1P17533 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Defa-rs1P17533 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Defa-rs1P17533 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Defa-rs1P17533 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Defa-rs1P17533 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Defa-rs1P17533 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Defa-rs1P17533 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Defa-rs1P17533 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Defa-rs1P17533 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Defa-rs1P17533 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Defa-rs1P17533 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Defa-rs1P17533 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Defa-rs1P17533 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Defa-rs1P17533 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Defa-rs1P17533 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Defa-rs1P17533 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Defa-rs1P17533 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Defa-rs1P17533 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Defa-rs1P17533 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Defa-rs1P17533 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Defa-rs1P17533 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Defa-rs1P17533 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Defa-rs1P17533 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Defa-rs1P17533 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Defa-rs1P17533 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Defa-rs1P17533 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Defa-rs1P17533 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Defa-rs1P17533 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Defa-rs1P17533 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Defa-rs1P17533 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms