Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ass1P16460 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ass1P16460 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ass1P16460 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ass1P16460 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ass1P16460 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ass1P16460 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ass1P16460 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ass1P16460 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ass1P16460 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ass1P16460 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ass1P16460 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ass1P16460 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ass1P16460 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ass1P16460 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ass1P16460 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ass1P16460 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ass1P16460 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ass1P16460 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ass1P16460 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ass1P16460 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ass1P16460 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ass1P16460 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ass1P16460 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ass1P16460 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ass1P16460 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ass1P16460 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ass1P16460 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ass1P16460 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ass1P16460 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ass1P16460 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ass1P16460 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ass1P16460 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ass1P16460 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ass1P16460 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ass1P16460 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ass1P16460 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ass1P16460 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ass1P16460 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ass1P16460 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ass1P16460 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ass1P16460 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ass1P16460 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ass1P16460 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ass1P16460 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ass1P16460 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ass1P16460 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ass1P16460 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ass1P16460 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ass1P16460 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ass1P16460 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ass1P16460 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ass1P16460 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ass1P16460 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ass1P16460 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ass1P16460 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ass1P16460 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ass1P16460 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ass1P16460 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ass1P16460 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ass1P16460 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ass1P16460 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ass1P16460 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ass1P16460 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ass1P16460 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ass1P16460 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ass1P16460 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ass1P16460 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ass1P16460 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ass1P16460 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ass1P16460 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ass1P16460 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ass1P16460 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ass1P16460 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ass1P16460 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ass1P16460 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ass1P16460 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ass1P16460 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ass1P16460 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ass1P16460 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ass1P16460 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ass1P16460 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ass1P16460 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ass1P16460 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ass1P16460 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ass1P16460 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ass1P16460 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ass1P16460 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ass1P16460 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ass1P16460 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ass1P16460 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ass1P16460 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ass1P16460 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ass1P16460 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ass1P16460 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ass1P16460 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ass1P16460 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ass1P16460 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ass1P16460 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ass1P16460 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms