Protein–RNA interactions for Protein: P14106

C1qb, Complement C1q subcomponent subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qbP14106 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1qbP14106 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1qbP14106 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1qbP14106 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1qbP14106 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1qbP14106 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1qbP14106 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1qbP14106 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1qbP14106 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C1qbP14106 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1qbP14106 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1qbP14106 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C1qbP14106 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1qbP14106 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1qbP14106 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1qbP14106 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1qbP14106 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1qbP14106 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1qbP14106 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1qbP14106 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1qbP14106 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1qbP14106 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1qbP14106 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1qbP14106 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1qbP14106 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1qbP14106 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1qbP14106 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1qbP14106 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1qbP14106 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1qbP14106 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1qbP14106 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1qbP14106 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1qbP14106 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1qbP14106 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1qbP14106 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1qbP14106 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1qbP14106 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1qbP14106 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C1qbP14106 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1qbP14106 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1qbP14106 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C1qbP14106 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1qbP14106 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1qbP14106 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1qbP14106 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1qbP14106 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1qbP14106 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1qbP14106 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1qbP14106 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1qbP14106 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1qbP14106 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1qbP14106 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1qbP14106 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1qbP14106 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1qbP14106 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1qbP14106 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1qbP14106 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1qbP14106 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1qbP14106 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1qbP14106 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1qbP14106 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1qbP14106 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1qbP14106 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1qbP14106 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1qbP14106 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1qbP14106 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C1qbP14106 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1qbP14106 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1qbP14106 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C1qbP14106 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1qbP14106 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1qbP14106 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1qbP14106 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1qbP14106 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1qbP14106 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C1qbP14106 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1qbP14106 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1qbP14106 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1qbP14106 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1qbP14106 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1qbP14106 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1qbP14106 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1qbP14106 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1qbP14106 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1qbP14106 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1qbP14106 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1qbP14106 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1qbP14106 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1qbP14106 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1qbP14106 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1qbP14106 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1qbP14106 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1qbP14106 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1qbP14106 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C1qbP14106 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1qbP14106 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1qbP14106 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1qbP14106 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1qbP14106 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1qbP14106 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms