Protein–RNA interactions for Protein: P12849

Prkar1b, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1bP12849 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkar1bP12849 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkar1bP12849 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkar1bP12849 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkar1bP12849 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkar1bP12849 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prkar1bP12849 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkar1bP12849 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkar1bP12849 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkar1bP12849 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkar1bP12849 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkar1bP12849 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkar1bP12849 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkar1bP12849 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkar1bP12849 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkar1bP12849 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkar1bP12849 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkar1bP12849 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prkar1bP12849 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkar1bP12849 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkar1bP12849 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkar1bP12849 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkar1bP12849 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkar1bP12849 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkar1bP12849 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prkar1bP12849 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkar1bP12849 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkar1bP12849 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkar1bP12849 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkar1bP12849 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkar1bP12849 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkar1bP12849 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkar1bP12849 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkar1bP12849 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkar1bP12849 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkar1bP12849 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkar1bP12849 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkar1bP12849 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkar1bP12849 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkar1bP12849 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkar1bP12849 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkar1bP12849 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkar1bP12849 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkar1bP12849 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkar1bP12849 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkar1bP12849 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkar1bP12849 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkar1bP12849 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkar1bP12849 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Prkar1bP12849 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkar1bP12849 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkar1bP12849 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkar1bP12849 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkar1bP12849 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkar1bP12849 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkar1bP12849 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkar1bP12849 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkar1bP12849 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkar1bP12849 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkar1bP12849 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkar1bP12849 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkar1bP12849 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkar1bP12849 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkar1bP12849 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkar1bP12849 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkar1bP12849 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkar1bP12849 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkar1bP12849 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkar1bP12849 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkar1bP12849 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkar1bP12849 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkar1bP12849 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkar1bP12849 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkar1bP12849 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkar1bP12849 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkar1bP12849 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkar1bP12849 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prkar1bP12849 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkar1bP12849 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkar1bP12849 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkar1bP12849 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkar1bP12849 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkar1bP12849 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkar1bP12849 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkar1bP12849 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkar1bP12849 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkar1bP12849 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkar1bP12849 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkar1bP12849 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkar1bP12849 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkar1bP12849 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkar1bP12849 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkar1bP12849 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkar1bP12849 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkar1bP12849 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkar1bP12849 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkar1bP12849 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkar1bP12849 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkar1bP12849 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkar1bP12849 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms