Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem254aP0DN89 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem254aP0DN89 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem254aP0DN89 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem254aP0DN89 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem254aP0DN89 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem254aP0DN89 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem254aP0DN89 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem254aP0DN89 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem254aP0DN89 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem254aP0DN89 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem254aP0DN89 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem254aP0DN89 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem254aP0DN89 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem254aP0DN89 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmem254aP0DN89 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem254aP0DN89 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem254aP0DN89 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem254aP0DN89 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem254aP0DN89 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem254aP0DN89 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem254aP0DN89 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem254aP0DN89 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem254aP0DN89 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem254aP0DN89 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem254aP0DN89 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem254aP0DN89 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem254aP0DN89 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem254aP0DN89 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem254aP0DN89 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem254aP0DN89 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem254aP0DN89 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem254aP0DN89 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem254aP0DN89 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem254aP0DN89 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem254aP0DN89 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem254aP0DN89 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem254aP0DN89 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem254aP0DN89 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem254aP0DN89 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem254aP0DN89 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem254aP0DN89 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem254aP0DN89 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem254aP0DN89 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem254aP0DN89 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem254aP0DN89 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem254aP0DN89 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem254aP0DN89 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem254aP0DN89 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem254aP0DN89 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem254aP0DN89 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem254aP0DN89 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem254aP0DN89 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem254aP0DN89 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem254aP0DN89 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem254aP0DN89 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem254aP0DN89 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem254aP0DN89 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem254aP0DN89 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem254aP0DN89 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem254aP0DN89 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem254aP0DN89 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem254aP0DN89 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem254aP0DN89 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem254aP0DN89 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem254aP0DN89 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem254aP0DN89 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem254aP0DN89 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem254aP0DN89 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem254aP0DN89 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem254aP0DN89 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem254aP0DN89 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem254aP0DN89 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem254aP0DN89 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem254aP0DN89 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem254aP0DN89 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem254aP0DN89 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem254aP0DN89 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem254aP0DN89 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem254aP0DN89 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem254aP0DN89 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem254aP0DN89 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem254aP0DN89 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem254aP0DN89 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem254aP0DN89 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem254aP0DN89 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem254aP0DN89 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem254aP0DN89 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem254aP0DN89 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem254aP0DN89 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem254aP0DN89 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem254aP0DN89 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem254aP0DN89 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem254aP0DN89 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem254aP0DN89 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem254aP0DN89 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem254aP0DN89 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem254aP0DN89 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem254aP0DN89 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem254aP0DN89 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms