Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Becn2P0DM65 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Becn2P0DM65 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Becn2P0DM65 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Becn2P0DM65 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Becn2P0DM65 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Becn2P0DM65 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Becn2P0DM65 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Becn2P0DM65 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Becn2P0DM65 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Becn2P0DM65 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Becn2P0DM65 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Becn2P0DM65 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Becn2P0DM65 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Becn2P0DM65 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Becn2P0DM65 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Becn2P0DM65 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Becn2P0DM65 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Becn2P0DM65 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Becn2P0DM65 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Becn2P0DM65 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Becn2P0DM65 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Becn2P0DM65 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Becn2P0DM65 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Becn2P0DM65 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Becn2P0DM65 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Becn2P0DM65 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Becn2P0DM65 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Becn2P0DM65 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Becn2P0DM65 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Becn2P0DM65 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Becn2P0DM65 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Becn2P0DM65 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Becn2P0DM65 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Becn2P0DM65 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Becn2P0DM65 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Becn2P0DM65 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Becn2P0DM65 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Becn2P0DM65 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Becn2P0DM65 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Becn2P0DM65 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Becn2P0DM65 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Becn2P0DM65 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Becn2P0DM65 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Becn2P0DM65 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Becn2P0DM65 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Becn2P0DM65 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Becn2P0DM65 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Becn2P0DM65 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Becn2P0DM65 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Becn2P0DM65 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Becn2P0DM65 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Becn2P0DM65 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Becn2P0DM65 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Becn2P0DM65 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Becn2P0DM65 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Becn2P0DM65 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Becn2P0DM65 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Becn2P0DM65 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Becn2P0DM65 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Becn2P0DM65 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Becn2P0DM65 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Becn2P0DM65 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Becn2P0DM65 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Becn2P0DM65 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Becn2P0DM65 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Becn2P0DM65 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Becn2P0DM65 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Becn2P0DM65 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Becn2P0DM65 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Becn2P0DM65 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Becn2P0DM65 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Becn2P0DM65 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Becn2P0DM65 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Becn2P0DM65 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Becn2P0DM65 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Becn2P0DM65 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Becn2P0DM65 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Becn2P0DM65 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Becn2P0DM65 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Becn2P0DM65 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Becn2P0DM65 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Becn2P0DM65 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Becn2P0DM65 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Becn2P0DM65 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Becn2P0DM65 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Becn2P0DM65 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Becn2P0DM65 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Becn2P0DM65 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Becn2P0DM65 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Becn2P0DM65 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Becn2P0DM65 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Becn2P0DM65 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Becn2P0DM65 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Becn2P0DM65 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Becn2P0DM65 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Becn2P0DM65 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Becn2P0DM65 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Becn2P0DM65 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Becn2P0DM65 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms