Protein–RNA interactions for Protein: P09065

En1, Homeobox protein engrailed-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
En1P09065 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
En1P09065 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
En1P09065 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
En1P09065 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
En1P09065 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
En1P09065 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
En1P09065 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
En1P09065 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
En1P09065 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
En1P09065 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
En1P09065 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
En1P09065 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
En1P09065 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
En1P09065 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
En1P09065 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
En1P09065 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
En1P09065 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
En1P09065 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
En1P09065 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
En1P09065 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
En1P09065 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
En1P09065 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
En1P09065 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
En1P09065 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
En1P09065 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
En1P09065 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
En1P09065 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
En1P09065 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
En1P09065 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
En1P09065 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
En1P09065 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
En1P09065 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
En1P09065 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
En1P09065 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
En1P09065 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
En1P09065 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
En1P09065 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
En1P09065 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
En1P09065 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
En1P09065 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
En1P09065 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
En1P09065 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
En1P09065 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
En1P09065 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
En1P09065 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
En1P09065 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
En1P09065 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
En1P09065 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
En1P09065 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
En1P09065 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
En1P09065 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
En1P09065 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
En1P09065 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
En1P09065 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
En1P09065 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
En1P09065 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
En1P09065 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
En1P09065 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
En1P09065 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
En1P09065 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
En1P09065 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
En1P09065 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
En1P09065 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
En1P09065 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
En1P09065 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
En1P09065 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
En1P09065 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
En1P09065 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
En1P09065 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
En1P09065 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
En1P09065 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
En1P09065 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
En1P09065 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
En1P09065 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
En1P09065 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
En1P09065 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
En1P09065 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
En1P09065 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
En1P09065 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
En1P09065 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
En1P09065 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
En1P09065 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
En1P09065 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
En1P09065 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
En1P09065 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
En1P09065 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
En1P09065 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
En1P09065 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
En1P09065 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
En1P09065 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
En1P09065 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
En1P09065 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
En1P09065 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
En1P09065 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
En1P09065 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
En1P09065 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
En1P09065 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
En1P09065 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
En1P09065 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
En1P09065 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms