Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mtnd1P03888 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mtnd1P03888 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mtnd1P03888 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mtnd1P03888 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mtnd1P03888 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mtnd1P03888 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mtnd1P03888 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mtnd1P03888 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Mtnd1P03888 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mtnd1P03888 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mtnd1P03888 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mtnd1P03888 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mtnd1P03888 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mtnd1P03888 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mtnd1P03888 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtnd1P03888 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mtnd1P03888 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Mtnd1P03888 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtnd1P03888 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtnd1P03888 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtnd1P03888 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtnd1P03888 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtnd1P03888 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtnd1P03888 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtnd1P03888 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mtnd1P03888 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mtnd1P03888 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtnd1P03888 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtnd1P03888 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtnd1P03888 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtnd1P03888 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtnd1P03888 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtnd1P03888 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtnd1P03888 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtnd1P03888 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtnd1P03888 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtnd1P03888 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtnd1P03888 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtnd1P03888 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtnd1P03888 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtnd1P03888 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtnd1P03888 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtnd1P03888 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtnd1P03888 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtnd1P03888 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtnd1P03888 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mtnd1P03888 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mtnd1P03888 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtnd1P03888 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtnd1P03888 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtnd1P03888 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtnd1P03888 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtnd1P03888 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtnd1P03888 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtnd1P03888 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtnd1P03888 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtnd1P03888 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtnd1P03888 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtnd1P03888 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtnd1P03888 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtnd1P03888 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtnd1P03888 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtnd1P03888 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtnd1P03888 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mtnd1P03888 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtnd1P03888 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtnd1P03888 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtnd1P03888 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtnd1P03888 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtnd1P03888 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtnd1P03888 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtnd1P03888 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtnd1P03888 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtnd1P03888 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtnd1P03888 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Mtnd1P03888 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mtnd1P03888 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mtnd1P03888 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mtnd1P03888 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtnd1P03888 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtnd1P03888 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mtnd1P03888 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mtnd1P03888 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mtnd1P03888 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mtnd1P03888 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtnd1P03888 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtnd1P03888 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtnd1P03888 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtnd1P03888 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mtnd1P03888 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mtnd1P03888 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mtnd1P03888 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtnd1P03888 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtnd1P03888 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtnd1P03888 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mtnd1P03888 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtnd1P03888 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtnd1P03888 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtnd1P03888 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms