Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01852 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01852 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01852 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
P01852 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01852 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01852 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01852 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01852 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01852 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01852 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01852 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01852 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01852 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P01852 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P01852 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01852 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01852 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01852 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01852 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01852 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01852 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01852 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01852 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01852 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01852 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
P01852 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01852 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01852 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01852 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01852 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01852 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01852 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01852 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01852 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01852 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01852 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01852 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01852 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01852 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01852 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01852 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01852 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01852 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01852 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01852 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01852 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01852 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01852 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
P01852 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01852 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01852 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01852 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01852 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01852 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01852 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01852 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01852 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
P01852 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01852 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01852 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01852 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01852 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01852 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01852 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01852 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01852 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01852 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
P01852 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01852 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01852 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01852 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01852 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
P01852 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01852 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01852 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
P01852 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01852 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01852 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01852 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01852 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
P01852 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01852 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01852 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01852 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01852 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01852 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01852 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01852 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01852 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01852 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01852 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01852 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01852 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01852 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01852 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01852 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01852 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01852 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01852 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms