Protein–RNA interactions for Protein: P01755

Ig heavy chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01755 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01755 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01755 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01755 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01755 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01755 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
P01755 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
P01755 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
P01755 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01755 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01755 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
P01755 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01755 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01755 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01755 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01755 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01755 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01755 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01755 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01755 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01755 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01755 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01755 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01755 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01755 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01755 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01755 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01755 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01755 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01755 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01755 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01755 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01755 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01755 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01755 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01755 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01755 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01755 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01755 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P01755 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01755 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01755 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01755 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01755 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01755 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01755 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01755 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01755 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01755 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01755 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01755 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
P01755 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01755 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01755 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01755 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01755 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01755 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01755 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P01755 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01755 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01755 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01755 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01755 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01755 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01755 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01755 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01755 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01755 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01755 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01755 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01755 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01755 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01755 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01755 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01755 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01755 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01755 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01755 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01755 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01755 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01755 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01755 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01755 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01755 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
P01755 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01755 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01755 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01755 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01755 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01755 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01755 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01755 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01755 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01755 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01755 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01755 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01755 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01755 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01755 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01755 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms