Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Robo1O89026 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Robo1O89026 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Robo1O89026 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Robo1O89026 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Robo1O89026 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Robo1O89026 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Robo1O89026 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Robo1O89026 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Robo1O89026 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Robo1O89026 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Robo1O89026 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Robo1O89026 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Robo1O89026 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Robo1O89026 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Robo1O89026 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Robo1O89026 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Robo1O89026 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Robo1O89026 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Robo1O89026 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Robo1O89026 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Robo1O89026 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Robo1O89026 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Robo1O89026 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Robo1O89026 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Robo1O89026 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Robo1O89026 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Robo1O89026 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Robo1O89026 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Robo1O89026 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Robo1O89026 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Robo1O89026 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Robo1O89026 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Robo1O89026 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Robo1O89026 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Robo1O89026 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Robo1O89026 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Robo1O89026 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Robo1O89026 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Robo1O89026 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Robo1O89026 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Robo1O89026 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Robo1O89026 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Robo1O89026 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Robo1O89026 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Robo1O89026 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Robo1O89026 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Robo1O89026 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Robo1O89026 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Robo1O89026 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Robo1O89026 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Robo1O89026 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Robo1O89026 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Robo1O89026 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Robo1O89026 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Robo1O89026 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Robo1O89026 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Robo1O89026 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Robo1O89026 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Robo1O89026 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Robo1O89026 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Robo1O89026 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Robo1O89026 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Robo1O89026 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Robo1O89026 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Robo1O89026 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Robo1O89026 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Robo1O89026 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Robo1O89026 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Robo1O89026 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Robo1O89026 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Robo1O89026 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Robo1O89026 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Robo1O89026 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Robo1O89026 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Robo1O89026 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Robo1O89026 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Robo1O89026 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Robo1O89026 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Robo1O89026 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Robo1O89026 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Robo1O89026 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Robo1O89026 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Robo1O89026 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Robo1O89026 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Robo1O89026 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Robo1O89026 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Robo1O89026 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Robo1O89026 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Robo1O89026 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Robo1O89026 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Robo1O89026 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Robo1O89026 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Robo1O89026 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Robo1O89026 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Robo1O89026 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Robo1O89026 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Robo1O89026 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Robo1O89026 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Robo1O89026 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms