Protein–RNA interactions for Protein: O88951

Lin7b, Protein lin-7 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin7bO88951 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin7bO88951 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lin7bO88951 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lin7bO88951 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lin7bO88951 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lin7bO88951 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lin7bO88951 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lin7bO88951 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lin7bO88951 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lin7bO88951 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lin7bO88951 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lin7bO88951 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lin7bO88951 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lin7bO88951 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lin7bO88951 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lin7bO88951 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lin7bO88951 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lin7bO88951 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lin7bO88951 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lin7bO88951 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lin7bO88951 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lin7bO88951 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lin7bO88951 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lin7bO88951 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lin7bO88951 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lin7bO88951 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lin7bO88951 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lin7bO88951 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lin7bO88951 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lin7bO88951 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lin7bO88951 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lin7bO88951 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lin7bO88951 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lin7bO88951 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lin7bO88951 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lin7bO88951 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lin7bO88951 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lin7bO88951 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lin7bO88951 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lin7bO88951 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lin7bO88951 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lin7bO88951 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lin7bO88951 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lin7bO88951 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lin7bO88951 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lin7bO88951 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lin7bO88951 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lin7bO88951 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lin7bO88951 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lin7bO88951 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lin7bO88951 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lin7bO88951 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lin7bO88951 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lin7bO88951 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lin7bO88951 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lin7bO88951 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lin7bO88951 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lin7bO88951 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lin7bO88951 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lin7bO88951 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lin7bO88951 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lin7bO88951 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lin7bO88951 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lin7bO88951 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lin7bO88951 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lin7bO88951 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lin7bO88951 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lin7bO88951 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lin7bO88951 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lin7bO88951 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lin7bO88951 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lin7bO88951 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lin7bO88951 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lin7bO88951 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lin7bO88951 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lin7bO88951 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lin7bO88951 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lin7bO88951 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lin7bO88951 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lin7bO88951 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lin7bO88951 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lin7bO88951 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lin7bO88951 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lin7bO88951 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lin7bO88951 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lin7bO88951 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lin7bO88951 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lin7bO88951 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lin7bO88951 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lin7bO88951 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lin7bO88951 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lin7bO88951 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lin7bO88951 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lin7bO88951 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lin7bO88951 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lin7bO88951 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lin7bO88951 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lin7bO88951 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lin7bO88951 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lin7bO88951 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms