Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcnkO88874 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcnkO88874 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CcnkO88874 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcnkO88874 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnkO88874 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnkO88874 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CcnkO88874 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcnkO88874 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CcnkO88874 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcnkO88874 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CcnkO88874 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CcnkO88874 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcnkO88874 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcnkO88874 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcnkO88874 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcnkO88874 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CcnkO88874 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcnkO88874 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CcnkO88874 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CcnkO88874 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CcnkO88874 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcnkO88874 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcnkO88874 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcnkO88874 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcnkO88874 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CcnkO88874 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CcnkO88874 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcnkO88874 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CcnkO88874 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnkO88874 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnkO88874 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnkO88874 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcnkO88874 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcnkO88874 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnkO88874 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnkO88874 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnkO88874 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnkO88874 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnkO88874 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnkO88874 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnkO88874 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnkO88874 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnkO88874 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcnkO88874 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcnkO88874 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CcnkO88874 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CcnkO88874 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CcnkO88874 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CcnkO88874 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CcnkO88874 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CcnkO88874 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CcnkO88874 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CcnkO88874 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CcnkO88874 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CcnkO88874 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CcnkO88874 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CcnkO88874 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CcnkO88874 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CcnkO88874 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CcnkO88874 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CcnkO88874 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CcnkO88874 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CcnkO88874 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CcnkO88874 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CcnkO88874 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CcnkO88874 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcnkO88874 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcnkO88874 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcnkO88874 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcnkO88874 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcnkO88874 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcnkO88874 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CcnkO88874 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CcnkO88874 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcnkO88874 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcnkO88874 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcnkO88874 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcnkO88874 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcnkO88874 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcnkO88874 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcnkO88874 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CcnkO88874 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcnkO88874 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcnkO88874 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcnkO88874 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CcnkO88874 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CcnkO88874 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CcnkO88874 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CcnkO88874 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CcnkO88874 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CcnkO88874 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcnkO88874 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcnkO88874 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcnkO88874 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcnkO88874 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcnkO88874 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcnkO88874 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcnkO88874 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcnkO88874 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms