Protein–RNA interactions for Protein: O88627

Slc28a2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a2O88627 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc28a2O88627 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc28a2O88627 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc28a2O88627 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc28a2O88627 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc28a2O88627 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc28a2O88627 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc28a2O88627 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc28a2O88627 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc28a2O88627 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc28a2O88627 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc28a2O88627 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc28a2O88627 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc28a2O88627 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc28a2O88627 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc28a2O88627 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc28a2O88627 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc28a2O88627 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc28a2O88627 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc28a2O88627 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc28a2O88627 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc28a2O88627 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc28a2O88627 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc28a2O88627 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc28a2O88627 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc28a2O88627 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc28a2O88627 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc28a2O88627 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc28a2O88627 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc28a2O88627 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc28a2O88627 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc28a2O88627 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc28a2O88627 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc28a2O88627 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc28a2O88627 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc28a2O88627 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc28a2O88627 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc28a2O88627 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc28a2O88627 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc28a2O88627 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc28a2O88627 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc28a2O88627 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc28a2O88627 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc28a2O88627 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc28a2O88627 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc28a2O88627 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc28a2O88627 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc28a2O88627 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc28a2O88627 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc28a2O88627 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc28a2O88627 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc28a2O88627 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc28a2O88627 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc28a2O88627 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc28a2O88627 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc28a2O88627 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc28a2O88627 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc28a2O88627 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc28a2O88627 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc28a2O88627 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc28a2O88627 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc28a2O88627 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc28a2O88627 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc28a2O88627 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc28a2O88627 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc28a2O88627 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc28a2O88627 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc28a2O88627 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc28a2O88627 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc28a2O88627 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc28a2O88627 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc28a2O88627 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc28a2O88627 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc28a2O88627 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc28a2O88627 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc28a2O88627 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc28a2O88627 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc28a2O88627 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc28a2O88627 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc28a2O88627 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc28a2O88627 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc28a2O88627 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc28a2O88627 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc28a2O88627 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc28a2O88627 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc28a2O88627 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc28a2O88627 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc28a2O88627 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc28a2O88627 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc28a2O88627 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc28a2O88627 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc28a2O88627 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc28a2O88627 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc28a2O88627 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc28a2O88627 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc28a2O88627 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc28a2O88627 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc28a2O88627 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc28a2O88627 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc28a2O88627 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms