Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacng2O88602 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacng2O88602 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacng2O88602 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacng2O88602 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacng2O88602 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacng2O88602 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacng2O88602 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacng2O88602 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacng2O88602 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacng2O88602 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacng2O88602 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacng2O88602 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacng2O88602 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacng2O88602 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacng2O88602 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacng2O88602 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacng2O88602 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacng2O88602 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacng2O88602 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacng2O88602 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacng2O88602 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacng2O88602 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacng2O88602 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacng2O88602 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacng2O88602 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacng2O88602 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacng2O88602 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacng2O88602 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacng2O88602 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacng2O88602 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacng2O88602 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacng2O88602 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacng2O88602 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacng2O88602 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacng2O88602 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacng2O88602 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacng2O88602 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacng2O88602 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacng2O88602 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacng2O88602 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacng2O88602 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacng2O88602 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacng2O88602 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacng2O88602 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacng2O88602 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacng2O88602 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacng2O88602 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacng2O88602 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacng2O88602 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacng2O88602 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacng2O88602 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacng2O88602 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacng2O88602 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacng2O88602 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacng2O88602 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacng2O88602 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacng2O88602 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacng2O88602 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacng2O88602 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacng2O88602 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacng2O88602 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacng2O88602 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacng2O88602 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacng2O88602 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacng2O88602 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng2O88602 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng2O88602 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng2O88602 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng2O88602 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng2O88602 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacng2O88602 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacng2O88602 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacng2O88602 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacng2O88602 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacng2O88602 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacng2O88602 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacng2O88602 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacng2O88602 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacng2O88602 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacng2O88602 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacng2O88602 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacng2O88602 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacng2O88602 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacng2O88602 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacng2O88602 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacng2O88602 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacng2O88602 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacng2O88602 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacng2O88602 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacng2O88602 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacng2O88602 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacng2O88602 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacng2O88602 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacng2O88602 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacng2O88602 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacng2O88602 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacng2O88602 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng2O88602 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacng2O88602 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms