Protein–RNA interactions for Protein: O88544

Cops4, COP9 signalosome complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops4O88544 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cops4O88544 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cops4O88544 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cops4O88544 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cops4O88544 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cops4O88544 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cops4O88544 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cops4O88544 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cops4O88544 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cops4O88544 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cops4O88544 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cops4O88544 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cops4O88544 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cops4O88544 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cops4O88544 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cops4O88544 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cops4O88544 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops4O88544 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops4O88544 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops4O88544 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops4O88544 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops4O88544 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cops4O88544 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cops4O88544 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cops4O88544 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cops4O88544 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cops4O88544 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cops4O88544 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cops4O88544 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops4O88544 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops4O88544 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cops4O88544 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cops4O88544 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cops4O88544 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cops4O88544 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cops4O88544 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cops4O88544 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cops4O88544 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops4O88544 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops4O88544 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops4O88544 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops4O88544 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops4O88544 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cops4O88544 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cops4O88544 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cops4O88544 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cops4O88544 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cops4O88544 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cops4O88544 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cops4O88544 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cops4O88544 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops4O88544 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops4O88544 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops4O88544 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops4O88544 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops4O88544 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops4O88544 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops4O88544 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops4O88544 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops4O88544 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cops4O88544 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cops4O88544 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cops4O88544 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cops4O88544 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cops4O88544 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cops4O88544 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops4O88544 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops4O88544 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops4O88544 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops4O88544 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops4O88544 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops4O88544 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops4O88544 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops4O88544 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cops4O88544 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cops4O88544 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cops4O88544 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cops4O88544 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cops4O88544 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cops4O88544 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cops4O88544 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cops4O88544 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops4O88544 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops4O88544 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops4O88544 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops4O88544 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops4O88544 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops4O88544 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cops4O88544 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cops4O88544 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cops4O88544 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cops4O88544 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops4O88544 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops4O88544 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops4O88544 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cops4O88544 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops4O88544 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops4O88544 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cops4O88544 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cops4O88544 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms