Protein–RNA interactions for Protein: O70238

Rhox6, Homeobox protein PSX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox6O70238 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhox6O70238 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhox6O70238 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhox6O70238 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhox6O70238 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhox6O70238 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhox6O70238 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhox6O70238 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhox6O70238 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhox6O70238 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhox6O70238 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhox6O70238 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhox6O70238 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhox6O70238 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhox6O70238 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhox6O70238 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhox6O70238 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox6O70238 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhox6O70238 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhox6O70238 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhox6O70238 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhox6O70238 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhox6O70238 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhox6O70238 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhox6O70238 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhox6O70238 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhox6O70238 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhox6O70238 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhox6O70238 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhox6O70238 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhox6O70238 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhox6O70238 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhox6O70238 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhox6O70238 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhox6O70238 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhox6O70238 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhox6O70238 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhox6O70238 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhox6O70238 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhox6O70238 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhox6O70238 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhox6O70238 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhox6O70238 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhox6O70238 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhox6O70238 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhox6O70238 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhox6O70238 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhox6O70238 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhox6O70238 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhox6O70238 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhox6O70238 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhox6O70238 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rhox6O70238 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhox6O70238 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhox6O70238 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhox6O70238 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox6O70238 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox6O70238 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhox6O70238 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhox6O70238 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhox6O70238 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhox6O70238 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhox6O70238 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhox6O70238 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhox6O70238 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhox6O70238 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhox6O70238 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhox6O70238 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhox6O70238 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhox6O70238 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhox6O70238 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rhox6O70238 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhox6O70238 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox6O70238 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox6O70238 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox6O70238 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox6O70238 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhox6O70238 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rhox6O70238 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhox6O70238 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhox6O70238 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhox6O70238 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox6O70238 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox6O70238 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhox6O70238 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox6O70238 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox6O70238 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox6O70238 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox6O70238 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhox6O70238 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhox6O70238 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox6O70238 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhox6O70238 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhox6O70238 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhox6O70238 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhox6O70238 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhox6O70238 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox6O70238 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox6O70238 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhox6O70238 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms