Protein–RNA interactions for Protein: O54998

Fkbp7, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP7, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fkbp7O54998 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Fkbp7O54998 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fkbp7O54998 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fkbp7O54998 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fkbp7O54998 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fkbp7O54998 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fkbp7O54998 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fkbp7O54998 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fkbp7O54998 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fkbp7O54998 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fkbp7O54998 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fkbp7O54998 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fkbp7O54998 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fkbp7O54998 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fkbp7O54998 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fkbp7O54998 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fkbp7O54998 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fkbp7O54998 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fkbp7O54998 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fkbp7O54998 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fkbp7O54998 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fkbp7O54998 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fkbp7O54998 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fkbp7O54998 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fkbp7O54998 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fkbp7O54998 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fkbp7O54998 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fkbp7O54998 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fkbp7O54998 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fkbp7O54998 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fkbp7O54998 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fkbp7O54998 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fkbp7O54998 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fkbp7O54998 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fkbp7O54998 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fkbp7O54998 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fkbp7O54998 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fkbp7O54998 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fkbp7O54998 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fkbp7O54998 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fkbp7O54998 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fkbp7O54998 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fkbp7O54998 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fkbp7O54998 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fkbp7O54998 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fkbp7O54998 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fkbp7O54998 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fkbp7O54998 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fkbp7O54998 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fkbp7O54998 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fkbp7O54998 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fkbp7O54998 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fkbp7O54998 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fkbp7O54998 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fkbp7O54998 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fkbp7O54998 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fkbp7O54998 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fkbp7O54998 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fkbp7O54998 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fkbp7O54998 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fkbp7O54998 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fkbp7O54998 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fkbp7O54998 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fkbp7O54998 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fkbp7O54998 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fkbp7O54998 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fkbp7O54998 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fkbp7O54998 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Fkbp7O54998 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fkbp7O54998 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fkbp7O54998 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fkbp7O54998 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fkbp7O54998 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fkbp7O54998 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fkbp7O54998 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fkbp7O54998 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fkbp7O54998 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fkbp7O54998 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fkbp7O54998 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fkbp7O54998 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fkbp7O54998 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fkbp7O54998 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fkbp7O54998 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Fkbp7O54998 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fkbp7O54998 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fkbp7O54998 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fkbp7O54998 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fkbp7O54998 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fkbp7O54998 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fkbp7O54998 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fkbp7O54998 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fkbp7O54998 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fkbp7O54998 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fkbp7O54998 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fkbp7O54998 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fkbp7O54998 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fkbp7O54998 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fkbp7O54998 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fkbp7O54998 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fkbp7O54998 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms