Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SlkO54988 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SlkO54988 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SlkO54988 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SlkO54988 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SlkO54988 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SlkO54988 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SlkO54988 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SlkO54988 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SlkO54988 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SlkO54988 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SlkO54988 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SlkO54988 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SlkO54988 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SlkO54988 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SlkO54988 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SlkO54988 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SlkO54988 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SlkO54988 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SlkO54988 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SlkO54988 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SlkO54988 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SlkO54988 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SlkO54988 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SlkO54988 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SlkO54988 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SlkO54988 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SlkO54988 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SlkO54988 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SlkO54988 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SlkO54988 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SlkO54988 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SlkO54988 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SlkO54988 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SlkO54988 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SlkO54988 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SlkO54988 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SlkO54988 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SlkO54988 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SlkO54988 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SlkO54988 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SlkO54988 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SlkO54988 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SlkO54988 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SlkO54988 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SlkO54988 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SlkO54988 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SlkO54988 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SlkO54988 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SlkO54988 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SlkO54988 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SlkO54988 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SlkO54988 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SlkO54988 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SlkO54988 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SlkO54988 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SlkO54988 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SlkO54988 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SlkO54988 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SlkO54988 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SlkO54988 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SlkO54988 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SlkO54988 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SlkO54988 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SlkO54988 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SlkO54988 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SlkO54988 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SlkO54988 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SlkO54988 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SlkO54988 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SlkO54988 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SlkO54988 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SlkO54988 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SlkO54988 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SlkO54988 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SlkO54988 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SlkO54988 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SlkO54988 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SlkO54988 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SlkO54988 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SlkO54988 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SlkO54988 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SlkO54988 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SlkO54988 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SlkO54988 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SlkO54988 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SlkO54988 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SlkO54988 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SlkO54988 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SlkO54988 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SlkO54988 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SlkO54988 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SlkO54988 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SlkO54988 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SlkO54988 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SlkO54988 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SlkO54988 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SlkO54988 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SlkO54988 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SlkO54988 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms