Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CrxO54751 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrxO54751 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CrxO54751 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CrxO54751 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CrxO54751 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrxO54751 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrxO54751 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrxO54751 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrxO54751 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrxO54751 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrxO54751 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrxO54751 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrxO54751 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CrxO54751 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrxO54751 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrxO54751 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrxO54751 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrxO54751 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrxO54751 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrxO54751 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrxO54751 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrxO54751 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CrxO54751 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CrxO54751 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CrxO54751 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CrxO54751 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CrxO54751 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CrxO54751 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CrxO54751 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CrxO54751 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CrxO54751 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CrxO54751 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CrxO54751 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CrxO54751 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CrxO54751 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CrxO54751 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CrxO54751 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CrxO54751 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CrxO54751 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CrxO54751 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CrxO54751 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CrxO54751 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CrxO54751 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrxO54751 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrxO54751 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrxO54751 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrxO54751 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrxO54751 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrxO54751 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrxO54751 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrxO54751 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrxO54751 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrxO54751 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrxO54751 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CrxO54751 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CrxO54751 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CrxO54751 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CrxO54751 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CrxO54751 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CrxO54751 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CrxO54751 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxO54751 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxO54751 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxO54751 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxO54751 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrxO54751 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxO54751 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxO54751 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxO54751 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrxO54751 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrxO54751 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrxO54751 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrxO54751 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrxO54751 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrxO54751 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrxO54751 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrxO54751 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CrxO54751 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrxO54751 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrxO54751 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CrxO54751 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrxO54751 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CrxO54751 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CrxO54751 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrxO54751 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrxO54751 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrxO54751 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrxO54751 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrxO54751 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrxO54751 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrxO54751 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrxO54751 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrxO54751 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrxO54751 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrxO54751 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrxO54751 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CrxO54751 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrxO54751 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrxO54751 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms