Protein–RNA interactions for Protein: O35936

Alox8, Arachidonate 8S-lipoxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alox8O35936 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Alox8O35936 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alox8O35936 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alox8O35936 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alox8O35936 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alox8O35936 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alox8O35936 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alox8O35936 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alox8O35936 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alox8O35936 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Alox8O35936 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Alox8O35936 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Alox8O35936 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Alox8O35936 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Alox8O35936 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Alox8O35936 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Alox8O35936 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Alox8O35936 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Alox8O35936 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Alox8O35936 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Alox8O35936 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Alox8O35936 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Alox8O35936 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Alox8O35936 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Alox8O35936 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Alox8O35936 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Alox8O35936 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Alox8O35936 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Alox8O35936 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alox8O35936 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alox8O35936 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Alox8O35936 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alox8O35936 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alox8O35936 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Alox8O35936 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Alox8O35936 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Alox8O35936 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Alox8O35936 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Alox8O35936 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Alox8O35936 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Alox8O35936 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Alox8O35936 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Alox8O35936 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Alox8O35936 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Alox8O35936 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Alox8O35936 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Alox8O35936 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Alox8O35936 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Alox8O35936 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alox8O35936 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alox8O35936 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Alox8O35936 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Alox8O35936 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Alox8O35936 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Alox8O35936 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Alox8O35936 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Alox8O35936 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Alox8O35936 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Alox8O35936 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Alox8O35936 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Alox8O35936 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Alox8O35936 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Alox8O35936 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Alox8O35936 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Alox8O35936 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Alox8O35936 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Alox8O35936 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Alox8O35936 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Alox8O35936 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Alox8O35936 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alox8O35936 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Alox8O35936 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alox8O35936 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alox8O35936 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alox8O35936 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Alox8O35936 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alox8O35936 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alox8O35936 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alox8O35936 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alox8O35936 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alox8O35936 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alox8O35936 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alox8O35936 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alox8O35936 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Alox8O35936 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alox8O35936 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alox8O35936 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alox8O35936 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alox8O35936 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alox8O35936 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alox8O35936 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Alox8O35936 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Alox8O35936 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alox8O35936 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alox8O35936 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alox8O35936 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alox8O35936 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alox8O35936 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alox8O35936 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alox8O35936 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms