Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chil3O35744 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chil3O35744 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chil3O35744 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chil3O35744 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chil3O35744 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chil3O35744 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Chil3O35744 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chil3O35744 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chil3O35744 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chil3O35744 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Chil3O35744 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chil3O35744 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chil3O35744 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chil3O35744 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chil3O35744 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chil3O35744 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chil3O35744 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chil3O35744 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chil3O35744 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chil3O35744 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Chil3O35744 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chil3O35744 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chil3O35744 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chil3O35744 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chil3O35744 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chil3O35744 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chil3O35744 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chil3O35744 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chil3O35744 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chil3O35744 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chil3O35744 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chil3O35744 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chil3O35744 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chil3O35744 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chil3O35744 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chil3O35744 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chil3O35744 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Chil3O35744 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chil3O35744 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chil3O35744 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chil3O35744 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Chil3O35744 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chil3O35744 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chil3O35744 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chil3O35744 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chil3O35744 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Chil3O35744 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chil3O35744 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chil3O35744 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chil3O35744 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chil3O35744 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chil3O35744 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chil3O35744 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chil3O35744 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chil3O35744 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chil3O35744 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chil3O35744 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chil3O35744 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chil3O35744 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chil3O35744 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chil3O35744 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chil3O35744 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chil3O35744 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chil3O35744 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chil3O35744 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chil3O35744 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chil3O35744 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chil3O35744 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chil3O35744 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chil3O35744 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chil3O35744 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chil3O35744 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chil3O35744 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chil3O35744 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chil3O35744 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chil3O35744 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chil3O35744 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chil3O35744 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chil3O35744 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chil3O35744 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chil3O35744 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chil3O35744 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chil3O35744 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chil3O35744 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chil3O35744 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chil3O35744 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chil3O35744 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chil3O35744 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chil3O35744 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chil3O35744 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chil3O35744 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chil3O35744 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chil3O35744 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chil3O35744 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chil3O35744 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chil3O35744 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chil3O35744 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chil3O35744 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chil3O35744 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms