Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TnxbO35452 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TnxbO35452 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TnxbO35452 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TnxbO35452 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TnxbO35452 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TnxbO35452 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TnxbO35452 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TnxbO35452 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TnxbO35452 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TnxbO35452 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TnxbO35452 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TnxbO35452 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TnxbO35452 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TnxbO35452 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TnxbO35452 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TnxbO35452 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TnxbO35452 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TnxbO35452 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TnxbO35452 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TnxbO35452 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TnxbO35452 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TnxbO35452 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TnxbO35452 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TnxbO35452 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TnxbO35452 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TnxbO35452 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TnxbO35452 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TnxbO35452 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TnxbO35452 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TnxbO35452 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TnxbO35452 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TnxbO35452 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TnxbO35452 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TnxbO35452 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TnxbO35452 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TnxbO35452 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TnxbO35452 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TnxbO35452 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TnxbO35452 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TnxbO35452 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TnxbO35452 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TnxbO35452 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TnxbO35452 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TnxbO35452 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TnxbO35452 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TnxbO35452 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TnxbO35452 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TnxbO35452 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TnxbO35452 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TnxbO35452 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TnxbO35452 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TnxbO35452 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TnxbO35452 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TnxbO35452 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TnxbO35452 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TnxbO35452 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TnxbO35452 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TnxbO35452 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TnxbO35452 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TnxbO35452 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TnxbO35452 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TnxbO35452 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TnxbO35452 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TnxbO35452 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TnxbO35452 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TnxbO35452 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TnxbO35452 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TnxbO35452 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TnxbO35452 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TnxbO35452 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TnxbO35452 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TnxbO35452 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TnxbO35452 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TnxbO35452 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TnxbO35452 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TnxbO35452 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TnxbO35452 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TnxbO35452 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TnxbO35452 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TnxbO35452 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TnxbO35452 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TnxbO35452 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TnxbO35452 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TnxbO35452 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TnxbO35452 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TnxbO35452 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TnxbO35452 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TnxbO35452 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TnxbO35452 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TnxbO35452 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TnxbO35452 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TnxbO35452 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TnxbO35452 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TnxbO35452 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TnxbO35452 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TnxbO35452 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TnxbO35452 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TnxbO35452 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TnxbO35452 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms