Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrt1O35449 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrt1O35449 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrt1O35449 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrt1O35449 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrt1O35449 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prrt1O35449 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrt1O35449 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prrt1O35449 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrt1O35449 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt1O35449 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt1O35449 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt1O35449 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrt1O35449 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrt1O35449 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrt1O35449 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrt1O35449 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrt1O35449 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrt1O35449 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrt1O35449 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrt1O35449 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrt1O35449 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrt1O35449 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrt1O35449 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrt1O35449 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrt1O35449 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrt1O35449 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrt1O35449 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrt1O35449 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrt1O35449 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrt1O35449 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrt1O35449 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrt1O35449 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrt1O35449 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrt1O35449 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrt1O35449 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrt1O35449 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrt1O35449 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrt1O35449 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrt1O35449 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrt1O35449 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrt1O35449 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prrt1O35449 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrt1O35449 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrt1O35449 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrt1O35449 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrt1O35449 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrt1O35449 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrt1O35449 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrt1O35449 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrt1O35449 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrt1O35449 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt1O35449 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prrt1O35449 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrt1O35449 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt1O35449 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt1O35449 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt1O35449 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt1O35449 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrt1O35449 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt1O35449 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrt1O35449 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrt1O35449 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrt1O35449 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrt1O35449 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrt1O35449 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrt1O35449 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrt1O35449 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrt1O35449 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrt1O35449 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrt1O35449 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrt1O35449 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrt1O35449 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrt1O35449 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt1O35449 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt1O35449 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt1O35449 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt1O35449 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt1O35449 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrt1O35449 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrt1O35449 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrt1O35449 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt1O35449 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt1O35449 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt1O35449 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt1O35449 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt1O35449 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrt1O35449 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrt1O35449 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrt1O35449 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrt1O35449 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrt1O35449 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrt1O35449 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prrt1O35449 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrt1O35449 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrt1O35449 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Prrt1O35449 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prrt1O35449 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrt1O35449 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prrt1O35449 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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