Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CenpaO35216 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CenpaO35216 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CenpaO35216 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpaO35216 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpaO35216 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpaO35216 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpaO35216 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpaO35216 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpaO35216 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpaO35216 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpaO35216 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CenpaO35216 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CenpaO35216 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpaO35216 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpaO35216 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpaO35216 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpaO35216 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CenpaO35216 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CenpaO35216 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CenpaO35216 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CenpaO35216 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CenpaO35216 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CenpaO35216 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CenpaO35216 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CenpaO35216 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CenpaO35216 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CenpaO35216 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CenpaO35216 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CenpaO35216 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CenpaO35216 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CenpaO35216 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpaO35216 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CenpaO35216 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CenpaO35216 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CenpaO35216 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CenpaO35216 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpaO35216 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpaO35216 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpaO35216 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CenpaO35216 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CenpaO35216 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CenpaO35216 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpaO35216 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpaO35216 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpaO35216 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CenpaO35216 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpaO35216 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpaO35216 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpaO35216 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpaO35216 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpaO35216 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpaO35216 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpaO35216 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpaO35216 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpaO35216 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpaO35216 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpaO35216 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpaO35216 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpaO35216 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpaO35216 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpaO35216 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpaO35216 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpaO35216 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpaO35216 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpaO35216 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpaO35216 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpaO35216 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpaO35216 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpaO35216 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenpaO35216 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenpaO35216 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpaO35216 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpaO35216 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpaO35216 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpaO35216 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpaO35216 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpaO35216 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpaO35216 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpaO35216 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CenpaO35216 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CenpaO35216 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CenpaO35216 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CenpaO35216 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CenpaO35216 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpaO35216 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpaO35216 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpaO35216 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpaO35216 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpaO35216 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpaO35216 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpaO35216 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpaO35216 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpaO35216 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpaO35216 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpaO35216 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpaO35216 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpaO35216 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpaO35216 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpaO35216 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.3 ms