Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ArxO35085 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ArxO35085 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ArxO35085 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ArxO35085 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ArxO35085 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ArxO35085 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ArxO35085 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ArxO35085 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
ArxO35085 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ArxO35085 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ArxO35085 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ArxO35085 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ArxO35085 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ArxO35085 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ArxO35085 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ArxO35085 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ArxO35085 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ArxO35085 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ArxO35085 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
ArxO35085 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ArxO35085 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
ArxO35085 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ArxO35085 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ArxO35085 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
ArxO35085 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ArxO35085 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ArxO35085 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ArxO35085 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ArxO35085 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ArxO35085 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ArxO35085 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ArxO35085 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ArxO35085 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ArxO35085 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ArxO35085 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ArxO35085 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ArxO35085 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ArxO35085 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
ArxO35085 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ArxO35085 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ArxO35085 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ArxO35085 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ArxO35085 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ArxO35085 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ArxO35085 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ArxO35085 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ArxO35085 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
ArxO35085 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ArxO35085 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ArxO35085 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ArxO35085 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ArxO35085 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ArxO35085 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ArxO35085 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
ArxO35085 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ArxO35085 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ArxO35085 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ArxO35085 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ArxO35085 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ArxO35085 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ArxO35085 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ArxO35085 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ArxO35085 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ArxO35085 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ArxO35085 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ArxO35085 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ArxO35085 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ArxO35085 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ArxO35085 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ArxO35085 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ArxO35085 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
ArxO35085 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ArxO35085 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ArxO35085 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ArxO35085 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ArxO35085 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ArxO35085 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ArxO35085 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ArxO35085 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ArxO35085 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ArxO35085 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ArxO35085 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ArxO35085 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ArxO35085 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ArxO35085 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ArxO35085 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ArxO35085 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ArxO35085 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ArxO35085 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ArxO35085 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ArxO35085 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ArxO35085 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ArxO35085 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ArxO35085 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ArxO35085 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ArxO35085 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ArxO35085 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ArxO35085 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
ArxO35085 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms