Protein–RNA interactions for Protein: O08899

Rgs4, Regulator of G-protein signaling 4, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rgs4O08899 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rgs4O08899 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rgs4O08899 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rgs4O08899 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rgs4O08899 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rgs4O08899 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rgs4O08899 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rgs4O08899 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rgs4O08899 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rgs4O08899 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rgs4O08899 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rgs4O08899 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rgs4O08899 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rgs4O08899 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rgs4O08899 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rgs4O08899 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rgs4O08899 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rgs4O08899 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rgs4O08899 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rgs4O08899 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rgs4O08899 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rgs4O08899 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rgs4O08899 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rgs4O08899 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rgs4O08899 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rgs4O08899 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rgs4O08899 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rgs4O08899 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rgs4O08899 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rgs4O08899 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rgs4O08899 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rgs4O08899 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rgs4O08899 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rgs4O08899 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rgs4O08899 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rgs4O08899 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rgs4O08899 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rgs4O08899 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rgs4O08899 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rgs4O08899 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rgs4O08899 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rgs4O08899 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rgs4O08899 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rgs4O08899 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rgs4O08899 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rgs4O08899 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rgs4O08899 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rgs4O08899 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rgs4O08899 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rgs4O08899 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rgs4O08899 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rgs4O08899 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rgs4O08899 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rgs4O08899 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rgs4O08899 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rgs4O08899 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rgs4O08899 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rgs4O08899 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rgs4O08899 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rgs4O08899 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rgs4O08899 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rgs4O08899 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rgs4O08899 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rgs4O08899 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rgs4O08899 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rgs4O08899 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rgs4O08899 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rgs4O08899 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rgs4O08899 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rgs4O08899 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rgs4O08899 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rgs4O08899 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rgs4O08899 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rgs4O08899 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rgs4O08899 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rgs4O08899 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rgs4O08899 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rgs4O08899 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rgs4O08899 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rgs4O08899 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rgs4O08899 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rgs4O08899 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rgs4O08899 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rgs4O08899 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rgs4O08899 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rgs4O08899 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rgs4O08899 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rgs4O08899 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rgs4O08899 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rgs4O08899 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rgs4O08899 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rgs4O08899 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rgs4O08899 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rgs4O08899 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rgs4O08899 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rgs4O08899 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rgs4O08899 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rgs4O08899 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rgs4O08899 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rgs4O08899 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms