Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ClockO08785 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ClockO08785 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ClockO08785 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ClockO08785 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ClockO08785 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ClockO08785 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ClockO08785 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ClockO08785 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ClockO08785 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ClockO08785 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ClockO08785 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ClockO08785 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClockO08785 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClockO08785 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ClockO08785 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ClockO08785 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClockO08785 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClockO08785 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClockO08785 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClockO08785 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClockO08785 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClockO08785 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClockO08785 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClockO08785 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClockO08785 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClockO08785 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClockO08785 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClockO08785 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClockO08785 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClockO08785 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClockO08785 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClockO08785 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClockO08785 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClockO08785 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClockO08785 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClockO08785 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClockO08785 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClockO08785 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClockO08785 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClockO08785 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ClockO08785 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ClockO08785 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClockO08785 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClockO08785 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClockO08785 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClockO08785 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClockO08785 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClockO08785 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClockO08785 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClockO08785 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClockO08785 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClockO08785 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ClockO08785 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClockO08785 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClockO08785 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClockO08785 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClockO08785 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClockO08785 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClockO08785 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClockO08785 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClockO08785 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClockO08785 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ClockO08785 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ClockO08785 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ClockO08785 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ClockO08785 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ClockO08785 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ClockO08785 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ClockO08785 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClockO08785 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ClockO08785 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClockO08785 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClockO08785 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClockO08785 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClockO08785 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClockO08785 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClockO08785 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ClockO08785 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ClockO08785 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClockO08785 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ClockO08785 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ClockO08785 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ClockO08785 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ClockO08785 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ClockO08785 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ClockO08785 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ClockO08785 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ClockO08785 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ClockO08785 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ClockO08785 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ClockO08785 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ClockO08785 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ClockO08785 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ClockO08785 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ClockO08785 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ClockO08785 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ClockO08785 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ClockO08785 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ClockO08785 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms