Protein–RNA interactions for Protein: O08709

Prdx6, Peroxiredoxin-6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdx6O08709 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdx6O08709 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdx6O08709 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdx6O08709 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdx6O08709 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdx6O08709 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdx6O08709 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdx6O08709 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdx6O08709 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdx6O08709 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdx6O08709 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdx6O08709 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdx6O08709 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdx6O08709 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdx6O08709 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdx6O08709 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdx6O08709 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdx6O08709 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdx6O08709 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdx6O08709 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdx6O08709 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prdx6O08709 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prdx6O08709 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdx6O08709 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdx6O08709 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdx6O08709 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdx6O08709 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdx6O08709 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdx6O08709 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdx6O08709 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdx6O08709 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdx6O08709 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdx6O08709 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdx6O08709 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdx6O08709 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdx6O08709 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdx6O08709 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdx6O08709 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdx6O08709 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdx6O08709 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdx6O08709 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdx6O08709 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdx6O08709 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdx6O08709 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdx6O08709 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdx6O08709 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdx6O08709 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdx6O08709 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdx6O08709 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdx6O08709 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdx6O08709 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdx6O08709 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdx6O08709 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdx6O08709 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdx6O08709 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdx6O08709 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdx6O08709 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdx6O08709 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdx6O08709 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdx6O08709 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdx6O08709 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdx6O08709 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdx6O08709 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdx6O08709 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdx6O08709 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdx6O08709 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdx6O08709 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdx6O08709 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdx6O08709 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdx6O08709 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdx6O08709 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdx6O08709 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdx6O08709 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdx6O08709 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdx6O08709 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdx6O08709 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdx6O08709 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdx6O08709 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdx6O08709 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdx6O08709 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdx6O08709 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdx6O08709 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdx6O08709 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdx6O08709 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdx6O08709 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdx6O08709 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdx6O08709 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdx6O08709 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdx6O08709 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdx6O08709 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdx6O08709 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdx6O08709 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdx6O08709 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdx6O08709 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdx6O08709 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdx6O08709 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdx6O08709 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdx6O08709 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdx6O08709 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdx6O08709 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms