Protein–RNA interactions for Protein: O08688

Capn5, Calpain-5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn5O08688 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Capn5O08688 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Capn5O08688 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Capn5O08688 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Capn5O08688 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Capn5O08688 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Capn5O08688 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Capn5O08688 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Capn5O08688 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Capn5O08688 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Capn5O08688 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Capn5O08688 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Capn5O08688 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Capn5O08688 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Capn5O08688 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Capn5O08688 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Capn5O08688 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn5O08688 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Capn5O08688 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Capn5O08688 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capn5O08688 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn5O08688 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn5O08688 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capn5O08688 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capn5O08688 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capn5O08688 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capn5O08688 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn5O08688 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capn5O08688 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn5O08688 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capn5O08688 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Capn5O08688 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Capn5O08688 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capn5O08688 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capn5O08688 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Capn5O08688 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Capn5O08688 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Capn5O08688 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capn5O08688 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn5O08688 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn5O08688 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn5O08688 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn5O08688 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn5O08688 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capn5O08688 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn5O08688 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn5O08688 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Capn5O08688 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Capn5O08688 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn5O08688 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn5O08688 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn5O08688 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn5O08688 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn5O08688 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn5O08688 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn5O08688 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn5O08688 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn5O08688 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Capn5O08688 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capn5O08688 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Capn5O08688 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn5O08688 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn5O08688 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn5O08688 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn5O08688 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn5O08688 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn5O08688 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capn5O08688 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Capn5O08688 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn5O08688 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capn5O08688 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capn5O08688 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Capn5O08688 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn5O08688 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn5O08688 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn5O08688 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Capn5O08688 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn5O08688 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn5O08688 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn5O08688 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn5O08688 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn5O08688 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn5O08688 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn5O08688 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn5O08688 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn5O08688 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capn5O08688 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Capn5O08688 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Capn5O08688 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Capn5O08688 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Capn5O08688 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Capn5O08688 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Capn5O08688 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Capn5O08688 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Capn5O08688 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capn5O08688 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Capn5O08688 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Capn5O08688 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Capn5O08688 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn5O08688 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms