Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MttpO08601 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MttpO08601 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MttpO08601 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MttpO08601 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MttpO08601 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MttpO08601 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MttpO08601 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MttpO08601 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MttpO08601 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MttpO08601 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MttpO08601 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MttpO08601 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MttpO08601 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MttpO08601 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MttpO08601 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MttpO08601 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MttpO08601 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MttpO08601 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MttpO08601 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MttpO08601 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MttpO08601 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MttpO08601 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MttpO08601 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MttpO08601 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MttpO08601 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MttpO08601 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MttpO08601 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MttpO08601 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MttpO08601 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MttpO08601 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MttpO08601 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MttpO08601 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MttpO08601 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MttpO08601 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MttpO08601 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MttpO08601 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MttpO08601 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MttpO08601 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MttpO08601 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MttpO08601 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MttpO08601 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MttpO08601 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MttpO08601 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MttpO08601 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MttpO08601 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MttpO08601 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MttpO08601 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MttpO08601 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MttpO08601 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MttpO08601 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MttpO08601 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MttpO08601 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MttpO08601 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MttpO08601 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MttpO08601 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MttpO08601 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MttpO08601 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MttpO08601 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MttpO08601 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MttpO08601 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MttpO08601 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MttpO08601 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MttpO08601 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MttpO08601 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MttpO08601 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MttpO08601 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MttpO08601 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MttpO08601 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MttpO08601 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MttpO08601 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MttpO08601 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MttpO08601 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MttpO08601 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MttpO08601 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MttpO08601 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MttpO08601 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MttpO08601 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MttpO08601 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MttpO08601 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MttpO08601 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MttpO08601 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MttpO08601 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MttpO08601 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MttpO08601 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MttpO08601 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MttpO08601 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MttpO08601 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MttpO08601 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MttpO08601 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MttpO08601 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MttpO08601 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MttpO08601 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MttpO08601 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MttpO08601 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MttpO08601 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MttpO08601 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MttpO08601 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MttpO08601 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MttpO08601 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms