Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cacna2d1O08532 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacna2d1O08532 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacna2d1O08532 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacna2d1O08532 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cacna2d1O08532 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cacna2d1O08532 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cacna2d1O08532 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cacna2d1O08532 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cacna2d1O08532 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cacna2d1O08532 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cacna2d1O08532 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cacna2d1O08532 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cacna2d1O08532 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cacna2d1O08532 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cacna2d1O08532 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cacna2d1O08532 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cacna2d1O08532 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cacna2d1O08532 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cacna2d1O08532 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cacna2d1O08532 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cacna2d1O08532 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cacna2d1O08532 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacna2d1O08532 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cacna2d1O08532 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Cacna2d1O08532 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cacna2d1O08532 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacna2d1O08532 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cacna2d1O08532 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cacna2d1O08532 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cacna2d1O08532 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cacna2d1O08532 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Cacna2d1O08532 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cacna2d1O08532 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cacna2d1O08532 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacna2d1O08532 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacna2d1O08532 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacna2d1O08532 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cacna2d1O08532 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cacna2d1O08532 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cacna2d1O08532 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cacna2d1O08532 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cacna2d1O08532 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacna2d1O08532 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cacna2d1O08532 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacna2d1O08532 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacna2d1O08532 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cacna2d1O08532 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cacna2d1O08532 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacna2d1O08532 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacna2d1O08532 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacna2d1O08532 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacna2d1O08532 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacna2d1O08532 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacna2d1O08532 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacna2d1O08532 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cacna2d1O08532 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cacna2d1O08532 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cacna2d1O08532 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cacna2d1O08532 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cacna2d1O08532 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacna2d1O08532 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacna2d1O08532 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cacna2d1O08532 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cacna2d1O08532 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cacna2d1O08532 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacna2d1O08532 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cacna2d1O08532 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cacna2d1O08532 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cacna2d1O08532 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cacna2d1O08532 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cacna2d1O08532 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cacna2d1O08532 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cacna2d1O08532 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cacna2d1O08532 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cacna2d1O08532 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cacna2d1O08532 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacna2d1O08532 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cacna2d1O08532 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacna2d1O08532 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacna2d1O08532 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cacna2d1O08532 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacna2d1O08532 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacna2d1O08532 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cacna2d1O08532 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna2d1O08532 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cacna2d1O08532 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cacna2d1O08532 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cacna2d1O08532 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna2d1O08532 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna2d1O08532 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna2d1O08532 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna2d1O08532 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cacna2d1O08532 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cacna2d1O08532 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacna2d1O08532 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacna2d1O08532 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacna2d1O08532 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cacna2d1O08532 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cacna2d1O08532 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms