Protein–RNA interactions for Protein: L7N471

Gm7980, Predicted gene 7980 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7980L7N471 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm7980L7N471 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm7980L7N471 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm7980L7N471 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm7980L7N471 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm7980L7N471 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm7980L7N471 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm7980L7N471 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm7980L7N471 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm7980L7N471 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm7980L7N471 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm7980L7N471 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm7980L7N471 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm7980L7N471 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm7980L7N471 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm7980L7N471 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm7980L7N471 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm7980L7N471 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm7980L7N471 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm7980L7N471 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm7980L7N471 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm7980L7N471 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm7980L7N471 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm7980L7N471 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm7980L7N471 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm7980L7N471 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm7980L7N471 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm7980L7N471 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm7980L7N471 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm7980L7N471 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm7980L7N471 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm7980L7N471 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm7980L7N471 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm7980L7N471 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm7980L7N471 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm7980L7N471 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm7980L7N471 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm7980L7N471 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm7980L7N471 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm7980L7N471 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm7980L7N471 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm7980L7N471 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm7980L7N471 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm7980L7N471 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm7980L7N471 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm7980L7N471 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm7980L7N471 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm7980L7N471 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7980L7N471 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm7980L7N471 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm7980L7N471 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7980L7N471 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7980L7N471 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7980L7N471 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7980L7N471 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm7980L7N471 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm7980L7N471 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7980L7N471 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7980L7N471 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm7980L7N471 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm7980L7N471 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm7980L7N471 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm7980L7N471 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm7980L7N471 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm7980L7N471 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm7980L7N471 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm7980L7N471 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm7980L7N471 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm7980L7N471 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm7980L7N471 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm7980L7N471 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm7980L7N471 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm7980L7N471 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm7980L7N471 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm7980L7N471 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm7980L7N471 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm7980L7N471 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm7980L7N471 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm7980L7N471 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm7980L7N471 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm7980L7N471 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm7980L7N471 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm7980L7N471 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm7980L7N471 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm7980L7N471 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm7980L7N471 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm7980L7N471 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm7980L7N471 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm7980L7N471 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm7980L7N471 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm7980L7N471 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm7980L7N471 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm7980L7N471 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm7980L7N471 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm7980L7N471 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm7980L7N471 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm7980L7N471 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm7980L7N471 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm7980L7N471 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm7980L7N471 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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