Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C0

Gm6401, Predicted gene 6401 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6401L7N2C0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm6401L7N2C0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm6401L7N2C0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm6401L7N2C0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm6401L7N2C0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm6401L7N2C0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm6401L7N2C0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm6401L7N2C0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm6401L7N2C0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm6401L7N2C0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm6401L7N2C0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm6401L7N2C0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm6401L7N2C0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm6401L7N2C0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm6401L7N2C0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm6401L7N2C0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm6401L7N2C0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm6401L7N2C0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm6401L7N2C0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm6401L7N2C0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm6401L7N2C0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm6401L7N2C0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm6401L7N2C0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm6401L7N2C0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm6401L7N2C0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm6401L7N2C0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6401L7N2C0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6401L7N2C0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6401L7N2C0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm6401L7N2C0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm6401L7N2C0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm6401L7N2C0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm6401L7N2C0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6401L7N2C0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6401L7N2C0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6401L7N2C0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6401L7N2C0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6401L7N2C0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6401L7N2C0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6401L7N2C0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6401L7N2C0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6401L7N2C0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm6401L7N2C0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm6401L7N2C0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm6401L7N2C0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm6401L7N2C0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm6401L7N2C0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6401L7N2C0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6401L7N2C0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6401L7N2C0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm6401L7N2C0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6401L7N2C0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6401L7N2C0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6401L7N2C0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6401L7N2C0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6401L7N2C0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6401L7N2C0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6401L7N2C0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm6401L7N2C0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm6401L7N2C0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm6401L7N2C0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm6401L7N2C0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6401L7N2C0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6401L7N2C0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6401L7N2C0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6401L7N2C0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6401L7N2C0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6401L7N2C0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6401L7N2C0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6401L7N2C0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6401L7N2C0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm6401L7N2C0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm6401L7N2C0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm6401L7N2C0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6401L7N2C0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6401L7N2C0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6401L7N2C0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6401L7N2C0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6401L7N2C0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6401L7N2C0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6401L7N2C0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6401L7N2C0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm6401L7N2C0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm6401L7N2C0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm6401L7N2C0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm6401L7N2C0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm6401L7N2C0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm6401L7N2C0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm6401L7N2C0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6401L7N2C0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm6401L7N2C0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm6401L7N2C0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm6401L7N2C0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm6401L7N2C0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6401L7N2C0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6401L7N2C0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6401L7N2C0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6401L7N2C0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6401L7N2C0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6401L7N2C0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms