Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ5

Cfap73, Cilia- and flagella-associated protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap73J3QPZ5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cfap73J3QPZ5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cfap73J3QPZ5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cfap73J3QPZ5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cfap73J3QPZ5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cfap73J3QPZ5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cfap73J3QPZ5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cfap73J3QPZ5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cfap73J3QPZ5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cfap73J3QPZ5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cfap73J3QPZ5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfap73J3QPZ5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfap73J3QPZ5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfap73J3QPZ5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfap73J3QPZ5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfap73J3QPZ5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfap73J3QPZ5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfap73J3QPZ5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfap73J3QPZ5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfap73J3QPZ5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Cfap73J3QPZ5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cfap73J3QPZ5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cfap73J3QPZ5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cfap73J3QPZ5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cfap73J3QPZ5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cfap73J3QPZ5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cfap73J3QPZ5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cfap73J3QPZ5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cfap73J3QPZ5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cfap73J3QPZ5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cfap73J3QPZ5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cfap73J3QPZ5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cfap73J3QPZ5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cfap73J3QPZ5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cfap73J3QPZ5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cfap73J3QPZ5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cfap73J3QPZ5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cfap73J3QPZ5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cfap73J3QPZ5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cfap73J3QPZ5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cfap73J3QPZ5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cfap73J3QPZ5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cfap73J3QPZ5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cfap73J3QPZ5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cfap73J3QPZ5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cfap73J3QPZ5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cfap73J3QPZ5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cfap73J3QPZ5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cfap73J3QPZ5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cfap73J3QPZ5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cfap73J3QPZ5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cfap73J3QPZ5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cfap73J3QPZ5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cfap73J3QPZ5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cfap73J3QPZ5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cfap73J3QPZ5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cfap73J3QPZ5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cfap73J3QPZ5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cfap73J3QPZ5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cfap73J3QPZ5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cfap73J3QPZ5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cfap73J3QPZ5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cfap73J3QPZ5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cfap73J3QPZ5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cfap73J3QPZ5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Cfap73J3QPZ5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cfap73J3QPZ5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cfap73J3QPZ5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Cfap73J3QPZ5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cfap73J3QPZ5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cfap73J3QPZ5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cfap73J3QPZ5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cfap73J3QPZ5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cfap73J3QPZ5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cfap73J3QPZ5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cfap73J3QPZ5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cfap73J3QPZ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cfap73J3QPZ5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cfap73J3QPZ5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cfap73J3QPZ5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cfap73J3QPZ5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cfap73J3QPZ5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cfap73J3QPZ5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cfap73J3QPZ5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cfap73J3QPZ5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cfap73J3QPZ5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cfap73J3QPZ5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cfap73J3QPZ5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cfap73J3QPZ5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cfap73J3QPZ5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cfap73J3QPZ5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cfap73J3QPZ5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cfap73J3QPZ5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cfap73J3QPZ5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cfap73J3QPZ5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cfap73J3QPZ5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cfap73J3QPZ5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cfap73J3QPZ5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cfap73J3QPZ5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Cfap73J3QPZ5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms