Protein–RNA interactions for Protein: J3QNQ5

Btbd35f24, BTB domain-containing 35, family member 24, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f24J3QNQ5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Btbd35f24J3QNQ5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Btbd35f24J3QNQ5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Btbd35f24J3QNQ5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Btbd35f24J3QNQ5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Btbd35f24J3QNQ5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Btbd35f24J3QNQ5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Btbd35f24J3QNQ5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Btbd35f24J3QNQ5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Btbd35f24J3QNQ5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Btbd35f24J3QNQ5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Btbd35f24J3QNQ5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Btbd35f24J3QNQ5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Btbd35f24J3QNQ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Btbd35f24J3QNQ5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Btbd35f24J3QNQ5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Btbd35f24J3QNQ5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Btbd35f24J3QNQ5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Btbd35f24J3QNQ5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Btbd35f24J3QNQ5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Btbd35f24J3QNQ5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Btbd35f24J3QNQ5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Btbd35f24J3QNQ5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Btbd35f24J3QNQ5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Btbd35f24J3QNQ5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Btbd35f24J3QNQ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Btbd35f24J3QNQ5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Btbd35f24J3QNQ5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Btbd35f24J3QNQ5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Btbd35f24J3QNQ5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Btbd35f24J3QNQ5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Btbd35f24J3QNQ5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Btbd35f24J3QNQ5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Btbd35f24J3QNQ5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Btbd35f24J3QNQ5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Btbd35f24J3QNQ5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Btbd35f24J3QNQ5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Btbd35f24J3QNQ5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Btbd35f24J3QNQ5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Btbd35f24J3QNQ5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Btbd35f24J3QNQ5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Btbd35f24J3QNQ5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Btbd35f24J3QNQ5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Btbd35f24J3QNQ5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Btbd35f24J3QNQ5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Btbd35f24J3QNQ5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Btbd35f24J3QNQ5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Btbd35f24J3QNQ5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Btbd35f24J3QNQ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Btbd35f24J3QNQ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Btbd35f24J3QNQ5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Btbd35f24J3QNQ5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Btbd35f24J3QNQ5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Btbd35f24J3QNQ5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Btbd35f24J3QNQ5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Btbd35f24J3QNQ5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Btbd35f24J3QNQ5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Btbd35f24J3QNQ5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Btbd35f24J3QNQ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Btbd35f24J3QNQ5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Btbd35f24J3QNQ5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Btbd35f24J3QNQ5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Btbd35f24J3QNQ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Btbd35f24J3QNQ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Btbd35f24J3QNQ5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Btbd35f24J3QNQ5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Btbd35f24J3QNQ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Btbd35f24J3QNQ5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Btbd35f24J3QNQ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Btbd35f24J3QNQ5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Btbd35f24J3QNQ5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Btbd35f24J3QNQ5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Btbd35f24J3QNQ5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Btbd35f24J3QNQ5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Btbd35f24J3QNQ5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Btbd35f24J3QNQ5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Btbd35f24J3QNQ5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Btbd35f24J3QNQ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Btbd35f24J3QNQ5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Btbd35f24J3QNQ5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Btbd35f24J3QNQ5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Btbd35f24J3QNQ5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Btbd35f24J3QNQ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Btbd35f24J3QNQ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Btbd35f24J3QNQ5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Btbd35f24J3QNQ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Btbd35f24J3QNQ5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Btbd35f24J3QNQ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Btbd35f24J3QNQ5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Btbd35f24J3QNQ5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Btbd35f24J3QNQ5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Btbd35f24J3QNQ5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Btbd35f24J3QNQ5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Btbd35f24J3QNQ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Btbd35f24J3QNQ5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Btbd35f24J3QNQ5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Btbd35f24J3QNQ5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Btbd35f24J3QNQ5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Btbd35f24J3QNQ5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Btbd35f24J3QNQ5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms