Protein–RNA interactions for Protein: J3QN84

Gm21812, Predicted gene, 21812, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21812J3QN84 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm21812J3QN84 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm21812J3QN84 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm21812J3QN84 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm21812J3QN84 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm21812J3QN84 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm21812J3QN84 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm21812J3QN84 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm21812J3QN84 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21812J3QN84 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm21812J3QN84 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm21812J3QN84 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21812J3QN84 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21812J3QN84 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21812J3QN84 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21812J3QN84 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21812J3QN84 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm21812J3QN84 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21812J3QN84 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21812J3QN84 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21812J3QN84 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm21812J3QN84 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm21812J3QN84 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm21812J3QN84 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm21812J3QN84 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm21812J3QN84 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm21812J3QN84 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm21812J3QN84 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21812J3QN84 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21812J3QN84 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21812J3QN84 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21812J3QN84 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm21812J3QN84 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm21812J3QN84 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm21812J3QN84 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm21812J3QN84 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm21812J3QN84 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm21812J3QN84 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm21812J3QN84 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm21812J3QN84 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21812J3QN84 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21812J3QN84 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21812J3QN84 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21812J3QN84 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm21812J3QN84 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21812J3QN84 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21812J3QN84 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21812J3QN84 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21812J3QN84 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21812J3QN84 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21812J3QN84 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21812J3QN84 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21812J3QN84 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21812J3QN84 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21812J3QN84 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm21812J3QN84 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21812J3QN84 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21812J3QN84 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21812J3QN84 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21812J3QN84 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21812J3QN84 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21812J3QN84 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21812J3QN84 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21812J3QN84 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21812J3QN84 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21812J3QN84 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21812J3QN84 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21812J3QN84 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm21812J3QN84 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21812J3QN84 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21812J3QN84 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21812J3QN84 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21812J3QN84 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21812J3QN84 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21812J3QN84 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm21812J3QN84 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21812J3QN84 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21812J3QN84 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21812J3QN84 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21812J3QN84 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21812J3QN84 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21812J3QN84 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21812J3QN84 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21812J3QN84 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21812J3QN84 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21812J3QN84 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21812J3QN84 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21812J3QN84 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21812J3QN84 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21812J3QN84 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21812J3QN84 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21812J3QN84 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21812J3QN84 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21812J3QN84 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21812J3QN84 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21812J3QN84 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21812J3QN84 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21812J3QN84 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21812J3QN84 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21812J3QN84 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms