Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bbip1J3QMK2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bbip1J3QMK2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bbip1J3QMK2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bbip1J3QMK2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bbip1J3QMK2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bbip1J3QMK2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bbip1J3QMK2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bbip1J3QMK2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bbip1J3QMK2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Bbip1J3QMK2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bbip1J3QMK2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbip1J3QMK2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbip1J3QMK2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbip1J3QMK2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbip1J3QMK2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbip1J3QMK2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bbip1J3QMK2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bbip1J3QMK2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bbip1J3QMK2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bbip1J3QMK2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bbip1J3QMK2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bbip1J3QMK2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bbip1J3QMK2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bbip1J3QMK2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bbip1J3QMK2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bbip1J3QMK2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bbip1J3QMK2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bbip1J3QMK2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bbip1J3QMK2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bbip1J3QMK2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bbip1J3QMK2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bbip1J3QMK2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Bbip1J3QMK2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bbip1J3QMK2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bbip1J3QMK2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bbip1J3QMK2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bbip1J3QMK2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Bbip1J3QMK2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bbip1J3QMK2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bbip1J3QMK2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bbip1J3QMK2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bbip1J3QMK2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bbip1J3QMK2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bbip1J3QMK2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bbip1J3QMK2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bbip1J3QMK2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bbip1J3QMK2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bbip1J3QMK2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bbip1J3QMK2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bbip1J3QMK2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbip1J3QMK2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbip1J3QMK2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bbip1J3QMK2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bbip1J3QMK2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Bbip1J3QMK2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bbip1J3QMK2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bbip1J3QMK2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Bbip1J3QMK2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bbip1J3QMK2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bbip1J3QMK2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bbip1J3QMK2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bbip1J3QMK2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bbip1J3QMK2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bbip1J3QMK2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bbip1J3QMK2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bbip1J3QMK2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bbip1J3QMK2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bbip1J3QMK2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bbip1J3QMK2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bbip1J3QMK2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bbip1J3QMK2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bbip1J3QMK2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bbip1J3QMK2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bbip1J3QMK2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bbip1J3QMK2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bbip1J3QMK2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bbip1J3QMK2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bbip1J3QMK2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bbip1J3QMK2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bbip1J3QMK2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bbip1J3QMK2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bbip1J3QMK2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bbip1J3QMK2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbip1J3QMK2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbip1J3QMK2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bbip1J3QMK2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bbip1J3QMK2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bbip1J3QMK2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bbip1J3QMK2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bbip1J3QMK2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bbip1J3QMK2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bbip1J3QMK2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bbip1J3QMK2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bbip1J3QMK2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bbip1J3QMK2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bbip1J3QMK2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Bbip1J3QMK2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bbip1J3QMK2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bbip1J3QMK2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms