Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gm21969J3QJZ1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Gm21969J3QJZ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Gm21969J3QJZ1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gm21969J3QJZ1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Gm21969J3QJZ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gm21969J3QJZ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Gm21969J3QJZ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gm21969J3QJZ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gm21969J3QJZ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gm21969J3QJZ1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gm21969J3QJZ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gm21969J3QJZ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gm21969J3QJZ1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gm21969J3QJZ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gm21969J3QJZ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gm21969J3QJZ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gm21969J3QJZ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gm21969J3QJZ1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gm21969J3QJZ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Gm21969J3QJZ1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gm21969J3QJZ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gm21969J3QJZ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gm21969J3QJZ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gm21969J3QJZ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gm21969J3QJZ1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gm21969J3QJZ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gm21969J3QJZ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gm21969J3QJZ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gm21969J3QJZ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gm21969J3QJZ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gm21969J3QJZ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gm21969J3QJZ1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gm21969J3QJZ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gm21969J3QJZ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gm21969J3QJZ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gm21969J3QJZ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gm21969J3QJZ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gm21969J3QJZ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gm21969J3QJZ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gm21969J3QJZ1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gm21969J3QJZ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gm21969J3QJZ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gm21969J3QJZ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gm21969J3QJZ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gm21969J3QJZ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gm21969J3QJZ1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gm21969J3QJZ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gm21969J3QJZ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gm21969J3QJZ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gm21969J3QJZ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gm21969J3QJZ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gm21969J3QJZ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Gm21969J3QJZ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gm21969J3QJZ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gm21969J3QJZ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gm21969J3QJZ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gm21969J3QJZ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gm21969J3QJZ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gm21969J3QJZ1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gm21969J3QJZ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gm21969J3QJZ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gm21969J3QJZ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gm21969J3QJZ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gm21969J3QJZ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm21969J3QJZ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm21969J3QJZ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm21969J3QJZ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Gm21969J3QJZ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm21969J3QJZ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm21969J3QJZ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gm21969J3QJZ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gm21969J3QJZ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gm21969J3QJZ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gm21969J3QJZ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Gm21969J3QJZ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gm21969J3QJZ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gm21969J3QJZ1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Gm21969J3QJZ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gm21969J3QJZ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gm21969J3QJZ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm21969J3QJZ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm21969J3QJZ1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gm21969J3QJZ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gm21969J3QJZ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gm21969J3QJZ1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gm21969J3QJZ1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm21969J3QJZ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm21969J3QJZ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm21969J3QJZ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm21969J3QJZ1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm21969J3QJZ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm21969J3QJZ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gm21969J3QJZ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gm21969J3QJZ1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Gm21969J3QJZ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm21969J3QJZ1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm21969J3QJZ1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm21969J3QJZ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm21969J3QJZ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms