Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn20G5E8X0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn20G5E8X0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn20G5E8X0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn20G5E8X0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn20G5E8X0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn20G5E8X0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn20G5E8X0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn20G5E8X0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn20G5E8X0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn20G5E8X0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn20G5E8X0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn20G5E8X0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn20G5E8X0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn20G5E8X0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn20G5E8X0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn20G5E8X0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn20G5E8X0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn20G5E8X0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn20G5E8X0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn20G5E8X0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn20G5E8X0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn20G5E8X0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn20G5E8X0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn20G5E8X0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn20G5E8X0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn20G5E8X0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn20G5E8X0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn20G5E8X0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn20G5E8X0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn20G5E8X0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn20G5E8X0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cldn20G5E8X0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn20G5E8X0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn20G5E8X0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn20G5E8X0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn20G5E8X0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn20G5E8X0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn20G5E8X0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn20G5E8X0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn20G5E8X0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn20G5E8X0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn20G5E8X0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn20G5E8X0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn20G5E8X0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn20G5E8X0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn20G5E8X0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn20G5E8X0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn20G5E8X0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn20G5E8X0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn20G5E8X0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn20G5E8X0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn20G5E8X0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn20G5E8X0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn20G5E8X0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn20G5E8X0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn20G5E8X0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn20G5E8X0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn20G5E8X0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn20G5E8X0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn20G5E8X0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn20G5E8X0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cldn20G5E8X0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn20G5E8X0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn20G5E8X0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn20G5E8X0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn20G5E8X0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn20G5E8X0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn20G5E8X0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cldn20G5E8X0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn20G5E8X0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn20G5E8X0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn20G5E8X0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn20G5E8X0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn20G5E8X0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn20G5E8X0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn20G5E8X0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn20G5E8X0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn20G5E8X0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn20G5E8X0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn20G5E8X0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn20G5E8X0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn20G5E8X0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn20G5E8X0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn20G5E8X0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn20G5E8X0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn20G5E8X0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn20G5E8X0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn20G5E8X0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn20G5E8X0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn20G5E8X0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn20G5E8X0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn20G5E8X0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn20G5E8X0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn20G5E8X0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn20G5E8X0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn20G5E8X0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn20G5E8X0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn20G5E8X0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn20G5E8X0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms