Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
4933406M09RikG3XA12 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
4933406M09RikG3XA12 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
4933406M09RikG3XA12 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
4933406M09RikG3XA12 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
4933406M09RikG3XA12 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
4933406M09RikG3XA12 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
4933406M09RikG3XA12 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4933406M09RikG3XA12 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4933406M09RikG3XA12 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4933406M09RikG3XA12 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
4933406M09RikG3XA12 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4933406M09RikG3XA12 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4933406M09RikG3XA12 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4933406M09RikG3XA12 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
4933406M09RikG3XA12 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
4933406M09RikG3XA12 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
4933406M09RikG3XA12 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4933406M09RikG3XA12 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
4933406M09RikG3XA12 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
4933406M09RikG3XA12 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4933406M09RikG3XA12 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
4933406M09RikG3XA12 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
4933406M09RikG3XA12 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
4933406M09RikG3XA12 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
4933406M09RikG3XA12 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
4933406M09RikG3XA12 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
4933406M09RikG3XA12 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
4933406M09RikG3XA12 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
4933406M09RikG3XA12 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
4933406M09RikG3XA12 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
4933406M09RikG3XA12 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
4933406M09RikG3XA12 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
4933406M09RikG3XA12 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
4933406M09RikG3XA12 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
4933406M09RikG3XA12 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
4933406M09RikG3XA12 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
4933406M09RikG3XA12 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
4933406M09RikG3XA12 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
4933406M09RikG3XA12 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
4933406M09RikG3XA12 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
4933406M09RikG3XA12 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
4933406M09RikG3XA12 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
4933406M09RikG3XA12 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
4933406M09RikG3XA12 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
4933406M09RikG3XA12 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
4933406M09RikG3XA12 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
4933406M09RikG3XA12 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
4933406M09RikG3XA12 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
4933406M09RikG3XA12 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
4933406M09RikG3XA12 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4933406M09RikG3XA12 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4933406M09RikG3XA12 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
4933406M09RikG3XA12 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
4933406M09RikG3XA12 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4933406M09RikG3XA12 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4933406M09RikG3XA12 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4933406M09RikG3XA12 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4933406M09RikG3XA12 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4933406M09RikG3XA12 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
4933406M09RikG3XA12 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
4933406M09RikG3XA12 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
4933406M09RikG3XA12 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
4933406M09RikG3XA12 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
4933406M09RikG3XA12 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
4933406M09RikG3XA12 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
4933406M09RikG3XA12 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
4933406M09RikG3XA12 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
4933406M09RikG3XA12 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
4933406M09RikG3XA12 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.54■■■□□ 2
4933406M09RikG3XA12 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4933406M09RikG3XA12 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4933406M09RikG3XA12 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4933406M09RikG3XA12 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4933406M09RikG3XA12 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
4933406M09RikG3XA12 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
4933406M09RikG3XA12 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
4933406M09RikG3XA12 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
4933406M09RikG3XA12 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
4933406M09RikG3XA12 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
4933406M09RikG3XA12 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4933406M09RikG3XA12 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
4933406M09RikG3XA12 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
4933406M09RikG3XA12 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4933406M09RikG3XA12 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4933406M09RikG3XA12 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
4933406M09RikG3XA12 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
4933406M09RikG3XA12 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
4933406M09RikG3XA12 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
4933406M09RikG3XA12 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
4933406M09RikG3XA12 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
4933406M09RikG3XA12 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
4933406M09RikG3XA12 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
4933406M09RikG3XA12 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4933406M09RikG3XA12 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
4933406M09RikG3XA12 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
4933406M09RikG3XA12 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
4933406M09RikG3XA12 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
4933406M09RikG3XA12 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
4933406M09RikG3XA12 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms