Protein–RNA interactions for Protein: G3UZF1

Gm20509, Predicted gene 20509 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20509G3UZF1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm20509G3UZF1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm20509G3UZF1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm20509G3UZF1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm20509G3UZF1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm20509G3UZF1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm20509G3UZF1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm20509G3UZF1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm20509G3UZF1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm20509G3UZF1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm20509G3UZF1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm20509G3UZF1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm20509G3UZF1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm20509G3UZF1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm20509G3UZF1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm20509G3UZF1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm20509G3UZF1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm20509G3UZF1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm20509G3UZF1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm20509G3UZF1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm20509G3UZF1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm20509G3UZF1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm20509G3UZF1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm20509G3UZF1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm20509G3UZF1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm20509G3UZF1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm20509G3UZF1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm20509G3UZF1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm20509G3UZF1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm20509G3UZF1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm20509G3UZF1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm20509G3UZF1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm20509G3UZF1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm20509G3UZF1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm20509G3UZF1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm20509G3UZF1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm20509G3UZF1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm20509G3UZF1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm20509G3UZF1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm20509G3UZF1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm20509G3UZF1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm20509G3UZF1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm20509G3UZF1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm20509G3UZF1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm20509G3UZF1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm20509G3UZF1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm20509G3UZF1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm20509G3UZF1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm20509G3UZF1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm20509G3UZF1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm20509G3UZF1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm20509G3UZF1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm20509G3UZF1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm20509G3UZF1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm20509G3UZF1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm20509G3UZF1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm20509G3UZF1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm20509G3UZF1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm20509G3UZF1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm20509G3UZF1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20509G3UZF1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20509G3UZF1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20509G3UZF1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm20509G3UZF1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm20509G3UZF1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm20509G3UZF1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm20509G3UZF1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20509G3UZF1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20509G3UZF1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm20509G3UZF1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm20509G3UZF1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm20509G3UZF1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm20509G3UZF1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm20509G3UZF1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm20509G3UZF1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm20509G3UZF1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm20509G3UZF1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm20509G3UZF1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm20509G3UZF1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm20509G3UZF1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm20509G3UZF1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm20509G3UZF1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm20509G3UZF1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm20509G3UZF1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm20509G3UZF1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm20509G3UZF1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm20509G3UZF1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm20509G3UZF1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm20509G3UZF1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm20509G3UZF1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm20509G3UZF1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm20509G3UZF1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm20509G3UZF1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm20509G3UZF1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm20509G3UZF1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm20509G3UZF1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm20509G3UZF1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm20509G3UZF1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm20509G3UZF1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm20509G3UZF1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms