Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim15G3UY57 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim15G3UY57 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim15G3UY57 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim15G3UY57 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim15G3UY57 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim15G3UY57 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim15G3UY57 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim15G3UY57 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim15G3UY57 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim15G3UY57 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim15G3UY57 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim15G3UY57 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim15G3UY57 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim15G3UY57 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim15G3UY57 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim15G3UY57 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim15G3UY57 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim15G3UY57 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim15G3UY57 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim15G3UY57 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim15G3UY57 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim15G3UY57 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim15G3UY57 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim15G3UY57 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim15G3UY57 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim15G3UY57 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim15G3UY57 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim15G3UY57 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim15G3UY57 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim15G3UY57 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim15G3UY57 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim15G3UY57 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim15G3UY57 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim15G3UY57 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim15G3UY57 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim15G3UY57 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim15G3UY57 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim15G3UY57 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim15G3UY57 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim15G3UY57 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim15G3UY57 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim15G3UY57 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim15G3UY57 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim15G3UY57 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim15G3UY57 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim15G3UY57 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim15G3UY57 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim15G3UY57 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim15G3UY57 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim15G3UY57 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim15G3UY57 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim15G3UY57 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim15G3UY57 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim15G3UY57 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim15G3UY57 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim15G3UY57 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim15G3UY57 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim15G3UY57 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim15G3UY57 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim15G3UY57 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim15G3UY57 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim15G3UY57 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim15G3UY57 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim15G3UY57 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim15G3UY57 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim15G3UY57 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim15G3UY57 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim15G3UY57 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim15G3UY57 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim15G3UY57 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim15G3UY57 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim15G3UY57 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim15G3UY57 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim15G3UY57 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim15G3UY57 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim15G3UY57 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim15G3UY57 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim15G3UY57 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim15G3UY57 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim15G3UY57 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim15G3UY57 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim15G3UY57 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim15G3UY57 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim15G3UY57 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim15G3UY57 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim15G3UY57 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim15G3UY57 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim15G3UY57 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim15G3UY57 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim15G3UY57 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim15G3UY57 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim15G3UY57 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim15G3UY57 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim15G3UY57 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim15G3UY57 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim15G3UY57 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim15G3UY57 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim15G3UY57 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim15G3UY57 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms