Protein–RNA interactions for Protein: G3UW88

Gm44, MCG65130, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm44G3UW88 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm44G3UW88 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm44G3UW88 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm44G3UW88 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm44G3UW88 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm44G3UW88 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm44G3UW88 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm44G3UW88 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm44G3UW88 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm44G3UW88 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm44G3UW88 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm44G3UW88 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm44G3UW88 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm44G3UW88 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm44G3UW88 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm44G3UW88 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm44G3UW88 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm44G3UW88 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm44G3UW88 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm44G3UW88 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm44G3UW88 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm44G3UW88 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm44G3UW88 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm44G3UW88 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm44G3UW88 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm44G3UW88 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm44G3UW88 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm44G3UW88 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm44G3UW88 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm44G3UW88 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm44G3UW88 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm44G3UW88 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm44G3UW88 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm44G3UW88 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm44G3UW88 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm44G3UW88 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm44G3UW88 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm44G3UW88 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm44G3UW88 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm44G3UW88 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm44G3UW88 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm44G3UW88 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm44G3UW88 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm44G3UW88 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm44G3UW88 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm44G3UW88 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm44G3UW88 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm44G3UW88 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm44G3UW88 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm44G3UW88 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm44G3UW88 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm44G3UW88 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm44G3UW88 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm44G3UW88 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm44G3UW88 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm44G3UW88 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm44G3UW88 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm44G3UW88 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm44G3UW88 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm44G3UW88 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm44G3UW88 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm44G3UW88 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm44G3UW88 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm44G3UW88 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm44G3UW88 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm44G3UW88 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm44G3UW88 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm44G3UW88 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm44G3UW88 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm44G3UW88 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm44G3UW88 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm44G3UW88 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm44G3UW88 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm44G3UW88 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm44G3UW88 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm44G3UW88 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm44G3UW88 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm44G3UW88 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm44G3UW88 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm44G3UW88 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm44G3UW88 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm44G3UW88 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm44G3UW88 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm44G3UW88 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm44G3UW88 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm44G3UW88 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm44G3UW88 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm44G3UW88 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm44G3UW88 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm44G3UW88 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm44G3UW88 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm44G3UW88 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms