Protein–RNA interactions for Protein: F8WIA3

Gm20604, Predicted gene 20604, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20604F8WIA3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20604F8WIA3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20604F8WIA3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20604F8WIA3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20604F8WIA3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20604F8WIA3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20604F8WIA3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20604F8WIA3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20604F8WIA3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20604F8WIA3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20604F8WIA3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20604F8WIA3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20604F8WIA3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20604F8WIA3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20604F8WIA3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20604F8WIA3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20604F8WIA3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20604F8WIA3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20604F8WIA3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20604F8WIA3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20604F8WIA3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20604F8WIA3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20604F8WIA3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20604F8WIA3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20604F8WIA3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20604F8WIA3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20604F8WIA3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20604F8WIA3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20604F8WIA3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20604F8WIA3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20604F8WIA3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20604F8WIA3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20604F8WIA3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20604F8WIA3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20604F8WIA3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20604F8WIA3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20604F8WIA3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20604F8WIA3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20604F8WIA3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20604F8WIA3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20604F8WIA3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20604F8WIA3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20604F8WIA3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20604F8WIA3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20604F8WIA3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20604F8WIA3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20604F8WIA3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20604F8WIA3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20604F8WIA3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20604F8WIA3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20604F8WIA3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20604F8WIA3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20604F8WIA3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20604F8WIA3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20604F8WIA3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20604F8WIA3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20604F8WIA3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20604F8WIA3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20604F8WIA3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20604F8WIA3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20604F8WIA3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20604F8WIA3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20604F8WIA3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20604F8WIA3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20604F8WIA3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20604F8WIA3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20604F8WIA3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20604F8WIA3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20604F8WIA3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20604F8WIA3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20604F8WIA3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20604F8WIA3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20604F8WIA3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms