Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp9yF8VPU6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp9yF8VPU6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp9yF8VPU6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp9yF8VPU6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp9yF8VPU6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp9yF8VPU6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp9yF8VPU6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp9yF8VPU6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp9yF8VPU6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp9yF8VPU6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp9yF8VPU6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp9yF8VPU6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp9yF8VPU6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp9yF8VPU6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp9yF8VPU6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp9yF8VPU6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp9yF8VPU6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp9yF8VPU6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp9yF8VPU6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp9yF8VPU6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp9yF8VPU6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp9yF8VPU6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp9yF8VPU6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp9yF8VPU6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp9yF8VPU6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp9yF8VPU6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp9yF8VPU6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp9yF8VPU6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp9yF8VPU6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp9yF8VPU6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp9yF8VPU6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp9yF8VPU6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp9yF8VPU6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp9yF8VPU6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp9yF8VPU6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp9yF8VPU6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp9yF8VPU6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp9yF8VPU6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp9yF8VPU6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp9yF8VPU6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp9yF8VPU6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp9yF8VPU6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp9yF8VPU6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp9yF8VPU6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp9yF8VPU6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp9yF8VPU6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp9yF8VPU6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp9yF8VPU6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp9yF8VPU6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp9yF8VPU6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp9yF8VPU6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp9yF8VPU6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp9yF8VPU6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp9yF8VPU6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp9yF8VPU6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp9yF8VPU6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp9yF8VPU6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp9yF8VPU6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp9yF8VPU6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp9yF8VPU6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp9yF8VPU6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp9yF8VPU6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp9yF8VPU6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp9yF8VPU6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp9yF8VPU6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp9yF8VPU6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp9yF8VPU6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp9yF8VPU6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp9yF8VPU6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp9yF8VPU6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp9yF8VPU6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp9yF8VPU6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp9yF8VPU6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp9yF8VPU6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp9yF8VPU6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp9yF8VPU6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp9yF8VPU6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp9yF8VPU6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp9yF8VPU6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp9yF8VPU6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp9yF8VPU6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp9yF8VPU6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp9yF8VPU6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp9yF8VPU6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp9yF8VPU6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp9yF8VPU6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp9yF8VPU6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp9yF8VPU6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp9yF8VPU6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp9yF8VPU6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp9yF8VPU6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp9yF8VPU6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp9yF8VPU6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp9yF8VPU6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp9yF8VPU6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp9yF8VPU6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp9yF8VPU6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp9yF8VPU6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp9yF8VPU6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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