Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20538F6Z9R1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20538F6Z9R1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20538F6Z9R1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20538F6Z9R1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20538F6Z9R1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20538F6Z9R1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20538F6Z9R1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20538F6Z9R1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20538F6Z9R1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20538F6Z9R1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20538F6Z9R1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20538F6Z9R1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20538F6Z9R1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20538F6Z9R1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20538F6Z9R1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20538F6Z9R1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20538F6Z9R1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20538F6Z9R1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20538F6Z9R1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20538F6Z9R1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20538F6Z9R1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20538F6Z9R1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20538F6Z9R1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20538F6Z9R1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20538F6Z9R1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20538F6Z9R1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20538F6Z9R1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20538F6Z9R1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20538F6Z9R1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20538F6Z9R1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20538F6Z9R1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20538F6Z9R1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20538F6Z9R1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20538F6Z9R1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20538F6Z9R1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20538F6Z9R1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20538F6Z9R1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20538F6Z9R1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20538F6Z9R1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20538F6Z9R1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20538F6Z9R1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20538F6Z9R1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20538F6Z9R1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20538F6Z9R1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20538F6Z9R1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20538F6Z9R1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20538F6Z9R1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20538F6Z9R1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20538F6Z9R1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20538F6Z9R1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20538F6Z9R1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20538F6Z9R1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20538F6Z9R1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20538F6Z9R1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20538F6Z9R1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20538F6Z9R1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20538F6Z9R1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20538F6Z9R1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20538F6Z9R1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20538F6Z9R1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20538F6Z9R1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20538F6Z9R1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20538F6Z9R1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20538F6Z9R1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20538F6Z9R1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20538F6Z9R1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20538F6Z9R1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20538F6Z9R1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20538F6Z9R1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20538F6Z9R1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20538F6Z9R1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20538F6Z9R1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20538F6Z9R1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20538F6Z9R1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20538F6Z9R1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20538F6Z9R1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20538F6Z9R1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20538F6Z9R1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20538F6Z9R1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20538F6Z9R1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20538F6Z9R1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20538F6Z9R1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20538F6Z9R1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20538F6Z9R1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20538F6Z9R1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20538F6Z9R1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20538F6Z9R1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20538F6Z9R1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20538F6Z9R1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20538F6Z9R1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20538F6Z9R1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20538F6Z9R1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20538F6Z9R1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20538F6Z9R1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20538F6Z9R1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20538F6Z9R1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20538F6Z9R1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20538F6Z9R1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20538F6Z9R1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms