Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8220F6YKI2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8220F6YKI2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8220F6YKI2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8220F6YKI2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8220F6YKI2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8220F6YKI2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8220F6YKI2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8220F6YKI2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8220F6YKI2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8220F6YKI2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8220F6YKI2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8220F6YKI2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8220F6YKI2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8220F6YKI2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm8220F6YKI2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8220F6YKI2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8220F6YKI2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8220F6YKI2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8220F6YKI2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8220F6YKI2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8220F6YKI2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8220F6YKI2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8220F6YKI2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8220F6YKI2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8220F6YKI2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8220F6YKI2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8220F6YKI2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8220F6YKI2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8220F6YKI2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8220F6YKI2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8220F6YKI2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8220F6YKI2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8220F6YKI2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8220F6YKI2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8220F6YKI2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8220F6YKI2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8220F6YKI2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8220F6YKI2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8220F6YKI2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8220F6YKI2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8220F6YKI2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8220F6YKI2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8220F6YKI2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8220F6YKI2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8220F6YKI2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8220F6YKI2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8220F6YKI2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8220F6YKI2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8220F6YKI2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8220F6YKI2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8220F6YKI2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8220F6YKI2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8220F6YKI2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8220F6YKI2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8220F6YKI2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8220F6YKI2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8220F6YKI2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8220F6YKI2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8220F6YKI2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8220F6YKI2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8220F6YKI2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8220F6YKI2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8220F6YKI2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8220F6YKI2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8220F6YKI2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8220F6YKI2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8220F6YKI2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8220F6YKI2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8220F6YKI2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8220F6YKI2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8220F6YKI2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8220F6YKI2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8220F6YKI2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8220F6YKI2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm8220F6YKI2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm8220F6YKI2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm8220F6YKI2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm8220F6YKI2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm8220F6YKI2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm8220F6YKI2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm8220F6YKI2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8220F6YKI2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8220F6YKI2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm8220F6YKI2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm8220F6YKI2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm8220F6YKI2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm8220F6YKI2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm8220F6YKI2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm8220F6YKI2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm8220F6YKI2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm8220F6YKI2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm8220F6YKI2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm8220F6YKI2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm8220F6YKI2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm8220F6YKI2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm8220F6YKI2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm8220F6YKI2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm8220F6YKI2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm8220F6YKI2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms